267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2078 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3364  MotA/TolQ/ExbB proton channel  95.33 
 
 		 257 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2100  MotA/TolQ/ExbB proton channel  94.55 
 
 		 257 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3510  putative chemotaxis protein MotA (flagellar motor component)  85.21 
 
 		 257 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  84.05 
 
 		 257 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1495  MotA/TolQ/ExbB proton channel  84.44 
 
 		 257 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00626739  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  83.66 
 
 		 257 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4830  MotA/TolQ/ExbB proton channel  68.92 
 
 		 272 aa  354  6.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5297  MotA/TolQ/ExbB proton channel  68.92 
 
 		 257 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.94 
 
 		 257 aa  354  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0425767  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5375  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.73 
 
 		 257 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.486184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.4 
 
 		 292 aa  348  7e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.82 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  42.97 
 
 		 255 aa  204  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  43.75 
 
 		 255 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.71 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  41.04 
 
 		 253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  41.43 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.6 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  39.36 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  41.77 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  41.77 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  41.77 
 
 		 255 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  41.77 
 
 		 255 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  41.77 
 
 		 255 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  40.96 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  41.77 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  39.52 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  38.98 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  40.96 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.04 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  41.37 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.4 
 
 		 253 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  40.96 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  40.24 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  41.53 
 
 		 254 aa  191  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.37 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.572139  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.44 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  41.94 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.2 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  39.2 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  40.39 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  39.36 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  38.55 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.11 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  38.58 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  41.18 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.25 
 
 		 267 aa  181  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  38.4 
 
 		 254 aa  181  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.11 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.84 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.75 
 
 		 251 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  38.65 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  36.25 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.46 
 
 		 261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.8 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.25 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.15 
 
 		 252 aa  158  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.7 
 
 		 252 aa  158  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.68 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.7 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.13 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.59 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.9 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.6 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.92 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.55 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.06 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.97 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.68 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.68 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  34.36 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.16 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  34.88 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.3 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.54 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  32.94 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.66 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.85 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.84 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.66 
 
 		 265 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  33.59 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1340  flagellar motor protein MotP  32.43 
 
 		 277 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198794  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.77 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1504  flagellar motor protein MotP  32.41 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  32.11 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.17 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.47 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  33.47 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  32.42 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1544  flagellar motor protein MotP  31.27 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.14 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.14 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  31.17 
 
 		 246 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.28 
 
 		 266 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.58 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1803  flagellar motor protein MotP  32.02 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1725  flagellar motor protein MotP  31.62 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>