212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3000 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  100 
 
 
255 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  99.22 
 
 
255 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  99.22 
 
 
255 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  99.22 
 
 
255 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  92.94 
 
 
255 aa  478  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  92.94 
 
 
255 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  92.94 
 
 
255 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  91.76 
 
 
255 aa  471  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  88.24 
 
 
255 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  87.45 
 
 
255 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  86.67 
 
 
255 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  85.88 
 
 
255 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  84.31 
 
 
255 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  83.92 
 
 
255 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  81.89 
 
 
255 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  81.18 
 
 
255 aa  428  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  72.11 
 
 
254 aa  371  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  72.4 
 
 
253 aa  367  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  71.6 
 
 
253 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  69.57 
 
 
254 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  69.64 
 
 
253 aa  348  7e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  68.38 
 
 
254 aa  343  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  69.32 
 
 
254 aa  340  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.89 
 
 
251 aa  289  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  54.15 
 
 
253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  54.9 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.2 
 
 
255 aa  269  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.63 
 
 
258 aa  261  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.6 
 
 
250 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  43.32 
 
 
251 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  43.25 
 
 
254 aa  221  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.77 
 
 
288 aa  221  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.48 
 
 
251 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 
266 aa  216  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.91 
 
 
250 aa  208  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.14 
 
 
266 aa  208  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  42.4 
 
 
257 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.72 
 
 
267 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.73 
 
 
257 aa  205  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.94 
 
 
272 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  45.06 
 
 
255 aa  204  9e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.8 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2100  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.8 
 
 
257 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.8 
 
 
262 aa  199  5e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.66 
 
 
254 aa  198  7.999999999999999e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.77 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  44.27 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3364  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.96 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0112135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.2 
 
 
257 aa  194  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0425767  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.87 
 
 
255 aa  193  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.572139  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.31 
 
 
253 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.37 
 
 
257 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.6 
 
 
252 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.76 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.23 
 
 
257 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  42.55 
 
 
253 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.55 
 
 
253 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  37.5 
 
 
251 aa  185  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 
279 aa  184  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5375  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.13 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.486184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.89 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4830  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.7 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5297  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.7 
 
 
257 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.9 
 
 
251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.5 
 
 
292 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1495  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.04 
 
 
257 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00626739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3510  putative chemotaxis protein MotA (flagellar motor component)  39.36 
 
 
257 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.44 
 
 
256 aa  175  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  36.86 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.65 
 
 
254 aa  171  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.06 
 
 
251 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.2 
 
 
260 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.7 
 
 
252 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.22 
 
 
262 aa  168  7e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.11 
 
 
249 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.82 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.86 
 
 
254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.82 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.82 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  35.51 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.66 
 
 
254 aa  161  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  39 
 
 
260 aa  161  1e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.12 
 
 
265 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0541  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.4 
 
 
272 aa  158  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.26 
 
 
265 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  33.47 
 
 
246 aa  152  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.4 
 
 
277 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.55 
 
 
257 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.05 
 
 
267 aa  150  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  34 
 
 
246 aa  148  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  34.69 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.5 
 
 
260 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.57 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1340  flagellar motor protein MotP  34.39 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1504  flagellar motor protein MotP  33.07 
 
 
277 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.59 
 
 
260 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34 
 
 
265 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.04 
 
 
261 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>