More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2425 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 279 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.6 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.54 
 
 		 267 aa  225  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.98 
 
 		 251 aa  225  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  49.2 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  41.77 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.34 
 
 		 262 aa  222  6e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.37 
 
 		 252 aa  222  7e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.17 
 
 		 261 aa  221  9e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.97 
 
 		 252 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.8 
 
 		 262 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.31 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.83 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  40.08 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  40.16 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  40.56 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.66 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.37 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.51 
 
 		 262 aa  201  8e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.51 
 
 		 262 aa  201  8e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  38.96 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  41.77 
 
 		 259 aa  198  7.999999999999999e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  39.2 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  39.44 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.85 
 
 		 263 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  37.35 
 
 		 255 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  37.35 
 
 		 255 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  40 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.16 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  40 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  39.36 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  37.35 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.76 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  39.76 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  41.18 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  39.76 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.18 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  43.37 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.4 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  37.75 
 
 		 255 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  38.43 
 
 		 255 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.18 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.59 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.55 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  38.96 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  36.95 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  37.75 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  37.75 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  36.14 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  36.14 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  36.14 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.68 
 
 		 251 aa  185  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  36.14 
 
 		 255 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  37.35 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  37.14 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  39.59 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.8 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.96 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  35.34 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.7 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.8 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.43 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  36.95 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.33 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.86 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.63 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.73 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  40 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.45 
 
 		 267 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.89 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.2 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.34 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.89 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.8 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  37.96 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1504  flagellar motor protein MotP  36.8 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  35.16 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1340  flagellar motor protein MotP  35.89 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.74 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.1 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1746  flagellar motor protein MotP  36.4 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1539  flagellar motor protein MotP  37.3 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1515  flagellar motor protein MotP  36 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1544  flagellar motor protein MotP  34.8 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1658  flagellar motor protein MotP  37.3 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169098  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  33.06 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1803  flagellar motor protein MotP  36.4 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1725  flagellar motor protein MotP  36 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.65 
 
 		 253 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.18 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  35.86 
 
 		 253 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  35.92 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.86 
 
 		 253 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  34.69 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  35.89 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  35.1 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0494  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.39 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.868711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>