242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1394 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 253 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  92.49 
 
 		 253 aa  474  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  92.49 
 
 		 253 aa  474  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.04 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  43.72 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.23 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  45.53 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  42.19 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  42.74 
 
 		 254 aa  191  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.7 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  42.11 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  40.24 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  44.26 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  41.7 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  46.19 
 
 		 253 aa  188  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  43.4 
 
 		 255 aa  188  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  41.7 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  45.53 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  44.26 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  40.55 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.67 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  41.7 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  41.7 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  40.89 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  40.89 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  41.77 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.37 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.32 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  41.7 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  41.7 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  41.7 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  40.49 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  40.49 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  40.49 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  44.17 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.98 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  42.34 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  40.08 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  37.98 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.84 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.17 
 
 		 262 aa  168  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.58 
 
 		 254 aa  168  9e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.02 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.96 
 
 		 261 aa  165  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.54 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  38.13 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  35.6 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.99 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.6 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.65 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  34.82 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  37.6 
 
 		 255 aa  158  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.22 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.94 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.03 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.55 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.01 
 
 		 251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.94 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0541  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.69 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.2 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.2 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  36.48 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.21 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  36.1 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.22 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4287  chemotaxis motA protein  33.74 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  34.87 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  37.4 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.2 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  35.25 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.25 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  36.13 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  34.45 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  36.99 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.6 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  36.99 
 
 		 246 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.27 
 
 		 267 aa  138  7e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  34.02 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.87 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.572139  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.07 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  33.33 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  31.87 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  35.43 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3364  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.06 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.06 
 
 		 257 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.01 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.39 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  32.77 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  31.52 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3510  putative chemotaxis protein MotA (flagellar motor component)  33.87 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.16 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  32.93 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  32.13 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.89 
 
 		 257 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.24 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.91 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0425767  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  35.04 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2100  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.45 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.71 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00026  flagellar motor protein  32.62 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>