More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2766 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2766  motility protein A  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  45.04 
 
 
260 aa  218  7e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.97 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  37.45 
 
 
254 aa  209  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.92 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.77 
 
 
279 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.2 
 
 
252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.67 
 
 
266 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.18 
 
 
267 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  37.15 
 
 
251 aa  185  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.86 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  36.4 
 
 
255 aa  181  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.24 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.64 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  34.94 
 
 
253 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  34.94 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.5 
 
 
265 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  36.4 
 
 
254 aa  178  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.47 
 
 
251 aa  178  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  36.4 
 
 
255 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  37.36 
 
 
268 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.25 
 
 
265 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.15 
 
 
254 aa  176  4e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.21 
 
 
262 aa  176  5e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 
258 aa  175  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  34.94 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.74 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  36.86 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.34 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  35.6 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  36.86 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  34.4 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  35.29 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.86 
 
 
250 aa  172  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  36.86 
 
 
255 aa  172  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  34 
 
 
255 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.38 
 
 
254 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  36.47 
 
 
255 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  36.47 
 
 
255 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  36.47 
 
 
255 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  34.4 
 
 
255 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  34.4 
 
 
255 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  34.8 
 
 
255 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  33.73 
 
 
253 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.8 
 
 
255 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.51 
 
 
259 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  34.54 
 
 
254 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.86 
 
 
253 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  35.69 
 
 
255 aa  169  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  35.29 
 
 
255 aa  168  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.4 
 
 
260 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.27 
 
 
261 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.54 
 
 
249 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.94 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.84 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  31.87 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  34.54 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  34.11 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  35.71 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.46 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.6 
 
 
253 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  35.6 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.6 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  36.93 
 
 
255 aa  160  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.66 
 
 
254 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  34.39 
 
 
251 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.5 
 
 
260 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.4 
 
 
251 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.73 
 
 
267 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  38.62 
 
 
246 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.02 
 
 
267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.25 
 
 
265 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.67 
 
 
251 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  35.29 
 
 
256 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  36.33 
 
 
246 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  36.72 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.95 
 
 
272 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.37 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.72 
 
 
257 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0614  flagellar motor protein MotA  32.31 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.65 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  35.48 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31120  flagellar motor component  33.33 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.65 
 
 
261 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  35.2 
 
 
246 aa  145  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.83 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  33.06 
 
 
245 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2464  flagellar motor protein MotA  36.44 
 
 
263 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.407079  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.21 
 
 
261 aa  143  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.358452  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
257 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.5 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1949  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.18 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3364  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.27 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0112135 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.94 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.42 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.57 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0425767  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4621  flagellar motor protein MotA  31.92 
 
 
264 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>