278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1015 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
254 aa  501  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  66.4 
 
 
254 aa  345  3e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  66.93 
 
 
255 aa  343  1e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 
266 aa  205  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  42.29 
 
 
257 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 
251 aa  202  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  42.47 
 
 
253 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  44.27 
 
 
255 aa  202  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  45.06 
 
 
255 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  42.52 
 
 
253 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  45.67 
 
 
255 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  44.27 
 
 
255 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  45.06 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  40.56 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  45.06 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  45.06 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  42.75 
 
 
260 aa  199  3e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  43.87 
 
 
255 aa  199  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  44.66 
 
 
255 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  40.08 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  44.53 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  42.91 
 
 
255 aa  196  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  43.48 
 
 
255 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  43.48 
 
 
255 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.2 
 
 
262 aa  195  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  43.48 
 
 
255 aa  194  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.25 
 
 
252 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.68 
 
 
267 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.64 
 
 
272 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  40.8 
 
 
254 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.89 
 
 
262 aa  192  6e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.55 
 
 
261 aa  191  9e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  43.14 
 
 
254 aa  191  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  42 
 
 
253 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.4 
 
 
279 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  42.13 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  41.9 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  40.94 
 
 
255 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.29 
 
 
252 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.56 
 
 
262 aa  185  6e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  42.17 
 
 
256 aa  184  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.57 
 
 
250 aa  184  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  43.31 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.4 
 
 
262 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.4 
 
 
262 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.96 
 
 
250 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  41.57 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.69 
 
 
266 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  38.15 
 
 
259 aa  176  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.36 
 
 
258 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.62 
 
 
259 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.92 
 
 
265 aa  175  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.67 
 
 
251 aa  175  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  36.96 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.96 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.15 
 
 
255 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.86 
 
 
253 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.89 
 
 
265 aa  168  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.58 
 
 
253 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.1 
 
 
254 aa  165  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.92 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.74 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.6 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.47 
 
 
256 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  36.65 
 
 
263 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.8 
 
 
267 aa  161  9e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  34.69 
 
 
246 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.47 
 
 
254 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.43 
 
 
249 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.4 
 
 
263 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.51 
 
 
257 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.61 
 
 
249 aa  159  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.2 
 
 
262 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.64 
 
 
288 aa  158  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.8 
 
 
265 aa  158  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.34 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1340  flagellar motor protein MotP  33.33 
 
 
277 aa  155  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198794  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  35.06 
 
 
251 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2464  flagellar motor protein MotA  37.28 
 
 
263 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.407079  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  34.72 
 
 
263 aa  153  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.85 
 
 
265 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.06 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.572139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  32.81 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  32.65 
 
 
254 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  34.29 
 
 
246 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.4 
 
 
251 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.06 
 
 
247 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  33.06 
 
 
246 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  33.47 
 
 
246 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00026  flagellar motor protein  33.05 
 
 
237 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.23 
 
 
277 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  33.88 
 
 
246 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  34.29 
 
 
246 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  33.88 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  33.47 
 
 
246 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  33.47 
 
 
246 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0541  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.25 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  33.88 
 
 
246 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.56 
 
 
260 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.92 
 
 
257 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>