286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2871 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.87 
 
 		 253 aa  299  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  58.73 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.77 
 
 		 251 aa  295  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  42.8 
 
 		 254 aa  214  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  39.68 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.36 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.3 
 
 		 261 aa  201  9e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.91 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.92 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.8 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  38.06 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  37.65 
 
 		 253 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.96 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.4 
 
 		 272 aa  184  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.84 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  37.1 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  37.65 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  36 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.06 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  36.29 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  39.27 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  34.66 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  35.48 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.75 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.94 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  34.68 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3364  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.35 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  34.27 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  33.06 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  35.63 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  34.68 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  33.06 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  33.06 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  35.6 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  33.06 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  33.06 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2100  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.63 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  33.87 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  33.87 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  33.87 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.82 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  32.66 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.38 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.55 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  33.06 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3510  putative chemotaxis protein MotA (flagellar motor component)  36.11 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.48 
 
 		 255 aa  164  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1495  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 		 257 aa  164  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00626739  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.89 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.46 
 
 		 262 aa  162  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.46 
 
 		 262 aa  162  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.572139  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.26 
 
 		 262 aa  158  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.94 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  35.22 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.22 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.22 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.81 
 
 		 266 aa  155  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  32.67 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  32.26 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  33.99 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  32 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  32.8 
 
 		 253 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.4 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.73 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.2 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.2 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0425767  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  33.46 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.31 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.2 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.75 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4830  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5297  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5375  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.6 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.486184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.28 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.83 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.8 
 
 		 254 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.92 
 
 		 249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.5 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.39 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.11 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.3 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.35 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  33.06 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2933  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.61 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  30.2 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  31.84 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  32.65 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  32.65 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0494  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.6 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.868711  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34 
 
 		 301 aa  129  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.64 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>