More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2337 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 257 aa  507  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.47 
 
 		 261 aa  289  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.358452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.33 
 
 		 260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31120  flagellar motor component  51.23 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0749  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.76 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0968  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.06 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1660  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.81 
 
 		 257 aa  241  9e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2981  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.16 
 
 		 276 aa  232  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.44999 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.7 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.9 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.41 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  47.3 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.02 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.9 
 
 		 256 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  42 
 
 		 254 aa  194  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.8 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.19 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.47 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.67 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.13 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.62 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.02 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.75 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.15 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.36 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.36 
 
 		 261 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.82 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  39.06 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.08 
 
 		 277 aa  184  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  40.87 
 
 		 268 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  41.37 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  40 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.02 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  39.43 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1524  chemotaxis MotA protein  38.11 
 
 		 248 aa  178  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  41.63 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  42.34 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.65 
 
 		 267 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  41.63 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  41.53 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  38.43 
 
 		 246 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.14 
 
 		 247 aa  175  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  40.82 
 
 		 246 aa  175  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  40.82 
 
 		 246 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  41.53 
 
 		 246 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  40 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  40.41 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  40 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.8 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.25 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.43 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.77 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  40.32 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.81 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.793002 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00026  flagellar motor protein  38.49 
 
 		 237 aa  169  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1949  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.59 
 
 		 246 aa  169  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  34.68 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.73 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.62 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  39.02 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0614  flagellar motor protein MotA  35.38 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.38 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.38 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  37.7 
 
 		 246 aa  161  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  36.02 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2464  flagellar motor protein MotA  38.22 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.407079  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  37.4 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.86 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  36.99 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.02 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.74 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4621  flagellar motor protein MotA  36.15 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4287  chemotaxis motA protein  36.93 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.45 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3212  flagellar motor protein MotA  34.75 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  35.8 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  35.06 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.24 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.41 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0494  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.43 
 
 		 272 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.868711  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  34.92 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  33.33 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1168  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.77 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000172029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2933  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.4 
 
 		 255 aa  141  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.12 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4341  flagellar motor protein MotA  35 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4625  flagellar motor protein MotA  35.77 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4409  flagellar motor protein MotA  35.77 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4248  flagellar motor protein MotA  35.77 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4260  flagellar motor protein MotA  35.77 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4748  flagellar motor protein MotA  35.77 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.98 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.53 
 
 		 251 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3423  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.75 
 
 		 245 aa  138  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0834  flagellar motor protein MotA  31.1 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  33.33 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.72 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4640  flagellar motor protein MotA  35.68 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4641  flagellar motor protein MotA  35.68 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.428145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>