More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1794 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
272 aa  546  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.5 
 
 
265 aa  278  7e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.85 
 
 
260 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.82 
 
 
260 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  42.53 
 
 
268 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 
277 aa  214  9e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.51 
 
 
265 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  45.38 
 
 
263 aa  202  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.72 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.1 
 
 
266 aa  195  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.04 
 
 
256 aa  191  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  41.3 
 
 
246 aa  191  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.02 
 
 
257 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.41 
 
 
265 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.01 
 
 
254 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.01 
 
 
265 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  38.21 
 
 
254 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  40.56 
 
 
246 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.65 
 
 
262 aa  186  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.39 
 
 
261 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.98 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.19 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.8 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.26 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  36 
 
 
254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  40.24 
 
 
246 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.7 
 
 
249 aa  182  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.52 
 
 
249 aa  182  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.5 
 
 
267 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.86 
 
 
251 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  40.8 
 
 
246 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2981  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.84 
 
 
276 aa  178  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.44999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  37.96 
 
 
246 aa  178  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.72 
 
 
260 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1949  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
246 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.16 
 
 
261 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  40.56 
 
 
246 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31120  flagellar motor component  38 
 
 
253 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  40.16 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0749  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.4 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.07 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  37.55 
 
 
246 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  37.75 
 
 
246 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  37.14 
 
 
246 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0968  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.34 
 
 
256 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  35.02 
 
 
251 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.34 
 
 
261 aa  167  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.358452  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  37.96 
 
 
246 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  36.8 
 
 
246 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.12 
 
 
279 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  34.92 
 
 
257 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  36.73 
 
 
246 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.62 
 
 
262 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  38.71 
 
 
245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.69 
 
 
252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.61 
 
 
261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0614  flagellar motor protein MotA  33.72 
 
 
264 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  36.95 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  37.4 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  34.86 
 
 
260 aa  163  3e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  36.11 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.64 
 
 
266 aa  161  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0834  flagellar motor protein MotA  35.25 
 
 
253 aa  161  9e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  34.78 
 
 
253 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2464  flagellar motor protein MotA  38.11 
 
 
263 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.407079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1524  chemotaxis MotA protein  36.48 
 
 
248 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  36.59 
 
 
246 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00026  flagellar motor protein  37.45 
 
 
237 aa  158  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0494  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.38 
 
 
272 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.868711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.02 
 
 
257 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  34.47 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.23 
 
 
262 aa  155  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.59 
 
 
247 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2933  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.2 
 
 
255 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  32.95 
 
 
259 aa  152  7e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4621  flagellar motor protein MotA  33.72 
 
 
264 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  32.28 
 
 
253 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  35.89 
 
 
257 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.78 
 
 
263 aa  150  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.68 
 
 
246 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.91 
 
 
252 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.08 
 
 
267 aa  149  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  35.48 
 
 
257 aa  148  9e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  31.89 
 
 
253 aa  148  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3212  flagellar motor protein MotA  34.98 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1660  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.77 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  32.41 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4287  chemotaxis motA protein  34.29 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  31.62 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  32.41 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.67 
 
 
250 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  31.62 
 
 
255 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4999  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.16 
 
 
254 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.567523 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  30.83 
 
 
255 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  31.1 
 
 
255 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  31.23 
 
 
255 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  30.83 
 
 
255 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  30.83 
 
 
255 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  30.83 
 
 
255 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  33.78 
 
 
254 aa  143  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>