More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1568 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  100 
 
 		 246 aa  483  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  89.02 
 
 		 246 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  89.43 
 
 		 246 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  88.21 
 
 		 246 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  88.62 
 
 		 246 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  86.18 
 
 		 246 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  85.77 
 
 		 246 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  85.37 
 
 		 246 aa  423  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  80.49 
 
 		 246 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  80.49 
 
 		 246 aa  407  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  60.98 
 
 		 246 aa  325  5e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  63.01 
 
 		 246 aa  324  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.67 
 
 		 246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.63 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  56.1 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  55.28 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1524  chemotaxis MotA protein  51.64 
 
 		 248 aa  258  7e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00026  flagellar motor protein  54.43 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  51.84 
 
 		 246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  52.05 
 
 		 257 aa  249  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  52.24 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  51.64 
 
 		 257 aa  249  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  50.61 
 
 		 245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.75 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1949  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.98 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.75 
 
 		 254 aa  228  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.12 
 
 		 254 aa  228  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.93 
 
 		 254 aa  224  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.13 
 
 		 249 aa  224  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  45.93 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.67 
 
 		 249 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4287  chemotaxis motA protein  45.68 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.72 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.72 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.31 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.67 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.71 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.54 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.96 
 
 		 260 aa  194  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.49 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.06 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  40.57 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.22 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3423  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.34 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2933  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.21 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.59 
 
 		 266 aa  181  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4999  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.92 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.567523 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  43.18 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1376  putative flagellar motor protein (MotA)  37.04 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.41 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3787  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.27 
 
 		 254 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146883  normal  0.0197098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0968  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.24 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4630  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.86 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.220987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.86 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.65 
 
 		 252 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2359  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.27 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4599  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.86 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.666334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.82 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.21 
 
 		 252 aa  174  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5469  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.27 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.75 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  36.33 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.45 
 
 		 254 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.73 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.56 
 
 		 260 aa  166  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.55 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  36.78 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.55 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.62 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.358452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0494  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.13 
 
 		 272 aa  161  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.868711  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  34.29 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  37.5 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  34.69 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.69 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0749  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.78 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.1 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.4 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.793002 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  35.37 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0614  flagellar motor protein MotA  34.32 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31120  flagellar motor component  35.83 
 
 		 253 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.51 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.51 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.69 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2981  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.9 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.44999 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2464  flagellar motor protein MotA  35.37 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.407079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1660  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.37 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.08 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  35.1 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.24 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4621  flagellar motor protein MotA  34.32 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  33.88 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0834  flagellar motor protein MotA  35.68 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.84 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.01 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>