More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3589 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  100 
 
 		 254 aa  501  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64 
 
 		 252 aa  344  8e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.2 
 
 		 251 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.71 
 
 		 252 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  53.94 
 
 		 257 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.61 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  49.4 
 
 		 251 aa  254  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.21 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49 
 
 		 250 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.93 
 
 		 272 aa  246  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.2 
 
 		 266 aa  244  9e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.43 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  44.44 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.82 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.38 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  47.24 
 
 		 256 aa  225  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.77 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  42.86 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  44.05 
 
 		 255 aa  222  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  44.05 
 
 		 255 aa  221  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  43.25 
 
 		 255 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.63 
 
 		 262 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.63 
 
 		 262 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.6 
 
 		 251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  42.46 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  42.86 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  42.86 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  42.86 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  42.86 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  42.46 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  42.46 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.61 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  42.63 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  41.67 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  42.17 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  42.46 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  42.06 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  41.27 
 
 		 255 aa  214  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.8 
 
 		 251 aa  214  8e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  43.7 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  43.25 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.04 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.8 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  41.37 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  42.02 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.61 
 
 		 265 aa  211  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  40.94 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.64 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.6 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.2 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  37.45 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.68 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.57 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.16 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.08 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.34 
 
 		 249 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.75 
 
 		 249 aa  205  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  42.57 
 
 		 254 aa  204  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  38.52 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.5 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  39.45 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  40.16 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.17 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  41.67 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.97 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  38.52 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.56 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.77 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.9 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  39.34 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.85 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.37 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  38.93 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  39.75 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  40.57 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.86 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.34 
 
 		 253 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  41.34 
 
 		 253 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  39.18 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.78 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  39.18 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.82 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.33 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.06 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.55 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  37.3 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.17 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  38.11 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.25 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.78 
 
 		 267 aa  182  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  39.55 
 
 		 263 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  38.93 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.25 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  38.93 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.25 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.93 
 
 		 247 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.55 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.572139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>