219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1524 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
255 aa  513  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.572139  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.21 
 
 
257 aa  205  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.73 
 
 
267 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  41.7 
 
 
255 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  40.08 
 
 
255 aa  199  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.52 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  40.89 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  38.34 
 
 
253 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  38.87 
 
 
255 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.43 
 
 
250 aa  193  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  38.87 
 
 
255 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  38.87 
 
 
255 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  38.87 
 
 
255 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  41.09 
 
 
253 aa  192  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  37.94 
 
 
253 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.31 
 
 
255 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.37 
 
 
257 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  38.46 
 
 
255 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  41.8 
 
 
256 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  37.65 
 
 
255 aa  189  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.19 
 
 
257 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  38.93 
 
 
255 aa  188  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.65 
 
 
267 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  38.46 
 
 
255 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  38.06 
 
 
255 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  38.06 
 
 
255 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  38.46 
 
 
255 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  37.65 
 
 
255 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.7 
 
 
257 aa  185  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3364  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.9 
 
 
257 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0112135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2100  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.13 
 
 
257 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1495  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.19 
 
 
257 aa  185  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00626739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  38 
 
 
254 aa  185  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  37.74 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.49 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  38.93 
 
 
251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  37.45 
 
 
254 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3510  putative chemotaxis protein MotA (flagellar motor component)  37.01 
 
 
257 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  38.55 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  37.25 
 
 
254 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.51 
 
 
257 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0425767  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 
250 aa  174  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  35.71 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.58 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5297  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.59 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4830  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.59 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5375  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.59 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.486184 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  36.99 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  37.7 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.15 
 
 
272 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.56 
 
 
262 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  36.55 
 
 
257 aa  165  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.95 
 
 
251 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.82 
 
 
253 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.11 
 
 
266 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.54 
 
 
261 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 
251 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  36.95 
 
 
255 aa  159  5e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.17 
 
 
262 aa  159  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.41 
 
 
251 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.47 
 
 
252 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.74 
 
 
254 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 
252 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1504  flagellar motor protein MotP  35.63 
 
 
277 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.06 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.74 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  36.4 
 
 
254 aa  152  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1539  flagellar motor protein MotP  35.25 
 
 
254 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1658  flagellar motor protein MotP  35.25 
 
 
254 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1746  flagellar motor protein MotP  34.82 
 
 
277 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.36 
 
 
265 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1803  flagellar motor protein MotP  34.82 
 
 
277 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1515  flagellar motor protein MotP  34.41 
 
 
277 aa  148  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1725  flagellar motor protein MotP  34.41 
 
 
277 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.32 
 
 
259 aa  148  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.99 
 
 
279 aa  148  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.93 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.99 
 
 
260 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1544  flagellar motor protein MotP  33.98 
 
 
277 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  35.22 
 
 
253 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1340  flagellar motor protein MotP  32.82 
 
 
277 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198794  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.22 
 
 
253 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.14 
 
 
262 aa  142  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3653  flagellar motor protein MotP  35.32 
 
 
277 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1693  flagellar motor protein MotP  35.32 
 
 
277 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.53 
 
 
254 aa  142  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.4 
 
 
265 aa  141  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  32.94 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.78 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.47 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.47 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.81 
 
 
262 aa  139  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.82 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.68 
 
 
260 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.3 
 
 
277 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.921977  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.87 
 
 
253 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0494  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.57 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.868711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.71 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.1 
 
 
265 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>