More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3752 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 254 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  97.64 
 
 		 254 aa  497  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  82.81 
 
 		 256 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  76.38 
 
 		 254 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  74.8 
 
 		 254 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  73.2 
 
 		 249 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  70.49 
 
 		 249 aa  358  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  46.53 
 
 		 246 aa  245  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  46.34 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.61 
 
 		 261 aa  241  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.61 
 
 		 261 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  46.12 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.8 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  44.9 
 
 		 246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  47.15 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  47.15 
 
 		 246 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  46.75 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  46.75 
 
 		 246 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  46.12 
 
 		 246 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  45.93 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  47.15 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  47.15 
 
 		 246 aa  224  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.31 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1524  chemotaxis MotA protein  46.31 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  44.72 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  45.12 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  46.34 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  44.72 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1949  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.9 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.91 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  45.71 
 
 		 246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.49 
 
 		 265 aa  219  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2933  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.43 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.13 
 
 		 247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.5 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  47.04 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00026  flagellar motor protein  45.15 
 
 		 237 aa  208  9e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  40.57 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.17 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  44.31 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  43.92 
 
 		 257 aa  199  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2981  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.56 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.44999 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.92 
 
 		 265 aa  198  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.74 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.46 
 
 		 267 aa  195  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.9 
 
 		 257 aa  194  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.19 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.41 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.78 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.18 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.52 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31120  flagellar motor component  38.75 
 
 		 253 aa  185  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.8 
 
 		 272 aa  184  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  38.43 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.21 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.14 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.92 
 
 		 267 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2359  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.34 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3787  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.93 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146883  normal  0.0197098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4287  chemotaxis motA protein  38.84 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.51 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4630  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.51 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.220987  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.1 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.358452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0614  flagellar motor protein MotA  35.09 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5469  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.34 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  36.55 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  35.43 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1376  putative flagellar motor protein (MotA)  35.68 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  36.33 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.93 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.06 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4999  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.51 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.567523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.15 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.793002 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.65 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4599  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.68 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.666334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.65 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  35.92 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.78 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0749  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.1 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4621  flagellar motor protein MotA  35.09 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.94 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.1 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  36.29 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.19 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1168  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.01 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000172029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.74 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  34.66 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  34.66 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  34.66 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  37.14 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  38.15 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  34.66 
 
 		 255 aa  161  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0494  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.76 
 
 		 272 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.868711  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  34.66 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4341  flagellar motor protein MotA  35.85 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  33.86 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.06 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>