More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1168 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1168  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
258 aa  520  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000172029  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1621  flagellar motor protein MotA  57.98 
 
 
258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0359  flagellar motor protein MotA  57.98 
 
 
258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0382  flagellar motor protein MotA  57.59 
 
 
258 aa  310  1e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0230  flagellar motor protein MotA  58.98 
 
 
256 aa  309  2e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1340  flagellar motor protein MotA  59.14 
 
 
257 aa  308  5e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1192  flagellar motor protein MotA  55.25 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0834  flagellar motor protein MotA  52.17 
 
 
253 aa  259  3e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.01 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.61 
 
 
254 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.69 
 
 
261 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  33.47 
 
 
246 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.73 
 
 
246 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  35.51 
 
 
246 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  35.92 
 
 
246 aa  159  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.69 
 
 
261 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.69 
 
 
261 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.1 
 
 
256 aa  155  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  33.33 
 
 
246 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.02 
 
 
265 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00026  flagellar motor protein  35.17 
 
 
237 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.65 
 
 
254 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.29 
 
 
265 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  31.3 
 
 
246 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.85 
 
 
249 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  31.89 
 
 
263 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2464  flagellar motor protein MotA  34.39 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.407079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  35.37 
 
 
254 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  35.77 
 
 
254 aa  146  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.07 
 
 
265 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.3 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.44 
 
 
249 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  34.29 
 
 
246 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  32.52 
 
 
246 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.02 
 
 
247 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4287  chemotaxis motA protein  33.47 
 
 
244 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.13 
 
 
251 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  32.11 
 
 
245 aa  142  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.77 
 
 
257 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.11 
 
 
260 aa  141  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  34.29 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  33.86 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1949  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.43 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.47 
 
 
277 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  36.4 
 
 
255 aa  139  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  31.84 
 
 
246 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  32.65 
 
 
246 aa  138  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.4 
 
 
279 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.62 
 
 
267 aa  138  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  31.84 
 
 
246 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1524  chemotaxis MotA protein  34.85 
 
 
248 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.98 
 
 
260 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  32.24 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.61 
 
 
244 aa  137  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00732612  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.39 
 
 
262 aa  135  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  31.7 
 
 
268 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2933  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.35 
 
 
255 aa  135  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  31.84 
 
 
246 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  31.84 
 
 
246 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.3 
 
 
272 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.08 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  31.43 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0614  flagellar motor protein MotA  30.47 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  31.84 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.92 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.81 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  32.74 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31120  flagellar motor component  31.62 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.96 
 
 
260 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.08 
 
 
254 aa  128  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.14 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  30.74 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.71 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.358452  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0968  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.59 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  29.92 
 
 
257 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.72 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0749  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.17 
 
 
255 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  37.57 
 
 
257 aa  125  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.2 
 
 
266 aa  125  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.81 
 
 
262 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.81 
 
 
262 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.13 
 
 
252 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4621  flagellar motor protein MotA  30.86 
 
 
264 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.03 
 
 
262 aa  121  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.74 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1660  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.36 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.47 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.6 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.84 
 
 
253 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  29.84 
 
 
253 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.46 
 
 
253 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  30.56 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.06 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4999  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.75 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.567523 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3212  flagellar motor protein MotA  29.13 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2359  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.05 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3787  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.63 
 
 
254 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146883  normal  0.0197098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4630  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.63 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.220987  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4599  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.63 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.666334  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.63 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0165356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>