More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1340 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1340  flagellar motor protein MotA  100 
 
 
257 aa  526  1e-148  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0359  flagellar motor protein MotA  80.93 
 
 
258 aa  441  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0382  flagellar motor protein MotA  80.54 
 
 
258 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1621  flagellar motor protein MotA  80.54 
 
 
258 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0230  flagellar motor protein MotA  70.31 
 
 
256 aa  371  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1192  flagellar motor protein MotA  66.93 
 
 
257 aa  325  6e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1168  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.14 
 
 
258 aa  324  7e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000172029  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0834  flagellar motor protein MotA  50.2 
 
 
253 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.58 
 
 
261 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.58 
 
 
261 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  32.94 
 
 
263 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.51 
 
 
246 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00026  flagellar motor protein  35.17 
 
 
237 aa  148  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.65 
 
 
247 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.41 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  33.47 
 
 
246 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4287  chemotaxis motA protein  34.44 
 
 
244 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  33.06 
 
 
246 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.7 
 
 
244 aa  142  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00732612  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2464  flagellar motor protein MotA  34 
 
 
263 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.407079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.28 
 
 
249 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.8 
 
 
257 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  31.43 
 
 
246 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0749  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.4 
 
 
255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.42 
 
 
254 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.8 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  32.42 
 
 
254 aa  135  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.81 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.76 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.27 
 
 
254 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  32.93 
 
 
245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  31.3 
 
 
246 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  32.24 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.14 
 
 
251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  33.06 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.81 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  30.61 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  35.11 
 
 
268 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.07 
 
 
265 aa  129  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  28.98 
 
 
246 aa  129  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.06 
 
 
262 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  32.65 
 
 
246 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.02 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.92 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1524  chemotaxis MotA protein  31.95 
 
 
248 aa  126  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.39 
 
 
279 aa  126  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.83 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.71 
 
 
265 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  32.24 
 
 
246 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  31.43 
 
 
246 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0614  flagellar motor protein MotA  29.8 
 
 
264 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  31.84 
 
 
246 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2933  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
255 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  31.43 
 
 
246 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  32.24 
 
 
246 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  30.27 
 
 
257 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.13 
 
 
265 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  29.8 
 
 
246 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  30.2 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.52 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.17 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1949  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.8 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0968  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.4 
 
 
256 aa  118  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  29.51 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.74 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.48 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  31.15 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  36.61 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.51 
 
 
261 aa  113  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.358452  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  32.18 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  33.33 
 
 
253 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.52 
 
 
262 aa  112  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  30.61 
 
 
257 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4621  flagellar motor protein MotA  30.59 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.88 
 
 
266 aa  111  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31120  flagellar motor component  29.72 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.98 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  29.51 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1660  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.2 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.09 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  29.6 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.89 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  31.42 
 
 
255 aa  109  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.88 
 
 
277 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3212  flagellar motor protein MotA  32.03 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.87 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  29.6 
 
 
253 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  31.3 
 
 
255 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4341  flagellar motor protein MotA  32.03 
 
 
264 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  29.62 
 
 
255 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.27 
 
 
262 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.3 
 
 
252 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.95 
 
 
272 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  29.62 
 
 
255 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.81 
 
 
257 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  30.65 
 
 
255 aa  106  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.16 
 
 
262 aa  105  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.16 
 
 
262 aa  105  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  31.71 
 
 
254 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4999  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.93 
 
 
254 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.567523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>