More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0461 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  91.34 
 
 		 254 aa  463  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  77.73 
 
 		 256 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  75.98 
 
 		 254 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  74.8 
 
 		 254 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  76.64 
 
 		 249 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  75.3 
 
 		 249 aa  378  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  47.56 
 
 		 246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  47.97 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  46.53 
 
 		 246 aa  239  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  47.56 
 
 		 246 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  46.75 
 
 		 246 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  46.75 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  46.75 
 
 		 246 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  45.93 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.79 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  45.31 
 
 		 246 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.39 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  44.9 
 
 		 245 aa  229  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  46.75 
 
 		 246 aa  228  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.15 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.09 
 
 		 265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  45.93 
 
 		 246 aa  224  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  44.31 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.36 
 
 		 260 aa  221  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1524  chemotaxis MotA protein  45.9 
 
 		 248 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  44.31 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.53 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  43.09 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1949  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.87 
 
 		 246 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  43.9 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  43.55 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  39.68 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.53 
 
 		 247 aa  208  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2933  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.45 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.32 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  44.71 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  44.31 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.32 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.68 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2981  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.59 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.44999 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  45.67 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.94 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  38.65 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00026  flagellar motor protein  42.67 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.62 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.37 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.01 
 
 		 272 aa  188  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.73 
 
 		 261 aa  188  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.45 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.358452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.21 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.73 
 
 		 267 aa  185  6e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.65 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.78 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.96 
 
 		 279 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  36.68 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4287  chemotaxis motA protein  38.27 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0614  flagellar motor protein MotA  36.08 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31120  flagellar motor component  34.66 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  35.83 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1376  putative flagellar motor protein (MotA)  37.65 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4599  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.25 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.666334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.95 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  35.69 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2359  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.93 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3787  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.51 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146883  normal  0.0197098 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.65 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  36.25 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.1 
 
 		 254 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4630  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.1 
 
 		 254 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.220987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  36.65 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5469  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.93 
 
 		 254 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  34.38 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0968  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.15 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4999  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.51 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.567523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4621  flagellar motor protein MotA  36.47 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.93 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  36.25 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  36.25 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  36.25 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.92 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  36.22 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.32 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.793002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.89 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  34.13 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0749  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.66 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  35.46 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  35.46 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  35.46 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.52 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  35.46 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  34.01 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.21 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  34.01 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  34.66 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>