More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1858 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  100 
 
 		 246 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00026  flagellar motor protein  78.9 
 
 		 237 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.6 
 
 		 247 aa  322  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.45 
 
 		 246 aa  315  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  56.91 
 
 		 246 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  56.5 
 
 		 246 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  56.5 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  56.91 
 
 		 246 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  55.28 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  54.07 
 
 		 246 aa  271  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  55.69 
 
 		 246 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  56.1 
 
 		 246 aa  268  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  55.69 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  54.07 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  53.66 
 
 		 246 aa  263  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  51.02 
 
 		 246 aa  261  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  50.41 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1949  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.59 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  48.78 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  49.18 
 
 		 257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  48.77 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  49.39 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  48.57 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1524  chemotaxis MotA protein  47.54 
 
 		 248 aa  228  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.12 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.53 
 
 		 254 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.9 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.85 
 
 		 249 aa  214  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  44.31 
 
 		 254 aa  209  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.9 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.62 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  41.46 
 
 		 268 aa  201  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.94 
 
 		 265 aa  191  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.62 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.62 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2933  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.21 
 
 		 255 aa  188  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.56 
 
 		 265 aa  188  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.28 
 
 		 265 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.39 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.24 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4999  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.39 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.567523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0968  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.68 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4287  chemotaxis motA protein  39.09 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  40.24 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  36.89 
 
 		 254 aa  179  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1376  putative flagellar motor protein (MotA)  37.45 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  41.18 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.43 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.84 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.49 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3787  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.16 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146883  normal  0.0197098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4630  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.16 
 
 		 254 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.220987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.16 
 
 		 254 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2359  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.57 
 
 		 254 aa  174  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.34 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5469  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.57 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.57 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.59 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.96 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4599  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.45 
 
 		 254 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.666334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.21 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0614  flagellar motor protein MotA  37.25 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.3 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.358452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.43 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2464  flagellar motor protein MotA  38.62 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.407079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.96 
 
 		 279 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.2 
 
 		 260 aa  164  9e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.02 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.02 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.33 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.63 
 
 		 262 aa  162  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.69 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  36.05 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1168  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.51 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000172029  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.3 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  33.47 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0834  flagellar motor protein MotA  37.76 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31120  flagellar motor component  37.45 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.8 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.59 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4621  flagellar motor protein MotA  37.25 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.15 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.25 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.97 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3423  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.07 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.27 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  36.33 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  33.47 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.89 
 
 		 253 aa  151  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.793002 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1660  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.88 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.06 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0749  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2981  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.74 
 
 		 276 aa  148  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.44999 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.52 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00732612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3212  flagellar motor protein MotA  37.25 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4341  flagellar motor protein MotA  36.44 
 
 		 264 aa  148  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.1 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.592217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>