More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2017 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
261 aa  520  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.358452  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31120  flagellar motor component  67.46 
 
 
253 aa  363  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.11 
 
 
260 aa  291  7e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.47 
 
 
257 aa  289  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2981  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.61 
 
 
276 aa  275  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.44999 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1660  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.53 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0749  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.07 
 
 
255 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0968  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.56 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.76 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.77 
 
 
265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.54 
 
 
260 aa  205  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.43 
 
 
257 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.5 
 
 
260 aa  198  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.4 
 
 
265 aa  191  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.75 
 
 
249 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  43.87 
 
 
263 aa  189  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 
254 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
277 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.18 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.93 
 
 
249 aa  183  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  36.84 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.47 
 
 
265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.1 
 
 
265 aa  178  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.53 
 
 
261 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.53 
 
 
261 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.1 
 
 
254 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.15 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 
254 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  38.3 
 
 
246 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.43 
 
 
246 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  38.06 
 
 
268 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  34.01 
 
 
254 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.14 
 
 
247 aa  168  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.34 
 
 
272 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.4 
 
 
266 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  34.69 
 
 
246 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.77 
 
 
252 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  39.02 
 
 
246 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  36.33 
 
 
246 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  39.43 
 
 
246 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  36.33 
 
 
246 aa  163  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  39.02 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  38.62 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  39.02 
 
 
246 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  37.4 
 
 
246 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  37.4 
 
 
246 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  35.92 
 
 
245 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  37.75 
 
 
246 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  37.75 
 
 
246 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.07 
 
 
267 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.68 
 
 
266 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0614  flagellar motor protein MotA  31.84 
 
 
264 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  36.36 
 
 
246 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00026  flagellar motor protein  37.44 
 
 
237 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.84 
 
 
262 aa  155  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  34.62 
 
 
251 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  34.14 
 
 
263 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.35 
 
 
262 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.14 
 
 
262 aa  153  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.56 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.793002 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1949  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 
246 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  37.14 
 
 
246 aa  152  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35 
 
 
266 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1524  chemotaxis MotA protein  34.69 
 
 
248 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.03 
 
 
279 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  35.39 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  34 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.07 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  34.98 
 
 
257 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.55 
 
 
253 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4621  flagellar motor protein MotA  31.84 
 
 
264 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.49 
 
 
259 aa  143  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.39 
 
 
251 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.55 
 
 
251 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  33.21 
 
 
259 aa  143  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  33.73 
 
 
246 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.33 
 
 
272 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2464  flagellar motor protein MotA  34.65 
 
 
263 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.407079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  30.2 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.47 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  32.77 
 
 
254 aa  139  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  33.33 
 
 
253 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4341  flagellar motor protein MotA  31.46 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  33.33 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  32.55 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  33.2 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3212  flagellar motor protein MotA  30.94 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4625  flagellar motor protein MotA  32.21 
 
 
264 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4409  flagellar motor protein MotA  32.21 
 
 
264 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4248  flagellar motor protein MotA  32.21 
 
 
264 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4260  flagellar motor protein MotA  32.21 
 
 
264 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4748  flagellar motor protein MotA  32.21 
 
 
264 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  34.15 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  34.29 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  34.14 
 
 
256 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  33.74 
 
 
255 aa  132  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>