More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1295 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
262 aa  513  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.89 
 
 
262 aa  353  2e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.74 
 
 
262 aa  324  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.74 
 
 
262 aa  324  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.21 
 
 
262 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.76 
 
 
259 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.8 
 
 
279 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.66 
 
 
266 aa  211  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  42.13 
 
 
257 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  41.04 
 
 
251 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.49 
 
 
267 aa  208  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.15 
 
 
252 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.67 
 
 
252 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  41.46 
 
 
254 aa  203  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.32 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0494  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.43 
 
 
272 aa  199  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.868711  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.25 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  41.25 
 
 
260 aa  192  3e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.89 
 
 
254 aa  192  6e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.81 
 
 
263 aa  191  9e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  40.31 
 
 
254 aa  191  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.15 
 
 
261 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.62 
 
 
260 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.92 
 
 
265 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.06 
 
 
253 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  41.57 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.43 
 
 
250 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.18 
 
 
265 aa  188  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.32 
 
 
272 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  36.33 
 
 
246 aa  185  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  40.87 
 
 
251 aa  185  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.8 
 
 
250 aa  185  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  37.14 
 
 
246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.06 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  39.2 
 
 
255 aa  183  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  39.6 
 
 
254 aa  182  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  42.49 
 
 
263 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  36.58 
 
 
253 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.4 
 
 
256 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  42.64 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  39.77 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  38.85 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  40.41 
 
 
246 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  39.59 
 
 
246 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.84 
 
 
251 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  36.73 
 
 
246 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  39.59 
 
 
246 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  40.65 
 
 
246 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  37.6 
 
 
255 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  37.75 
 
 
254 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.71 
 
 
267 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  39.59 
 
 
246 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  38 
 
 
255 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  38 
 
 
255 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  37.05 
 
 
253 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  40 
 
 
246 aa  175  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  39.84 
 
 
246 aa  175  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  39.18 
 
 
246 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  37.6 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  38.46 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  38.46 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  39.46 
 
 
255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  38.46 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  39.59 
 
 
246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.65 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  38.46 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  35.1 
 
 
246 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  38.31 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  35.86 
 
 
253 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  36.8 
 
 
255 aa  171  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  38.62 
 
 
246 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.55 
 
 
265 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.7 
 
 
249 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  38.62 
 
 
246 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.25 
 
 
257 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.14 
 
 
260 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.21 
 
 
261 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.21 
 
 
261 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1539  flagellar motor protein MotP  38.11 
 
 
254 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1658  flagellar motor protein MotP  38.11 
 
 
254 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1504  flagellar motor protein MotP  37.85 
 
 
277 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.62 
 
 
246 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.8 
 
 
261 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.84 
 
 
249 aa  168  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  36.8 
 
 
255 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1746  flagellar motor protein MotP  37.45 
 
 
277 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.62 
 
 
272 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1803  flagellar motor protein MotP  37.45 
 
 
277 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  41.41 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  36.19 
 
 
255 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.11 
 
 
260 aa  166  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1515  flagellar motor protein MotP  37.05 
 
 
277 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  34.36 
 
 
257 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1725  flagellar motor protein MotP  37.05 
 
 
277 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.1 
 
 
254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1340  flagellar motor protein MotP  37.94 
 
 
277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198794  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  33.98 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.25 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.63 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>