265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2768 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  100 
 
 		 255 aa  502  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  89.8 
 
 		 255 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  88.24 
 
 		 255 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  86.67 
 
 		 255 aa  455  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  86.27 
 
 		 255 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  86.27 
 
 		 255 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  86.27 
 
 		 255 aa  454  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  87.01 
 
 		 255 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  85.88 
 
 		 255 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  85.88 
 
 		 255 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  87.06 
 
 		 255 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  86.27 
 
 		 255 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  85.88 
 
 		 255 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  85.88 
 
 		 255 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  85.88 
 
 		 255 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  83.53 
 
 		 255 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  73.71 
 
 		 254 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  71.94 
 
 		 254 aa  367  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  72.62 
 
 		 253 aa  368  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  72.62 
 
 		 253 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  71.26 
 
 		 253 aa  355  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  68.77 
 
 		 254 aa  350  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  71.2 
 
 		 254 aa  342  4e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.3 
 
 		 251 aa  295  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  56.52 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  58.43 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.6 
 
 		 255 aa  275  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.87 
 
 		 258 aa  271  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.2 
 
 		 250 aa  231  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  44.53 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.77 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  42.86 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.35 
 
 		 266 aa  220  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.06 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.15 
 
 		 257 aa  215  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.6 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  44 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.51 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.72 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 272 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.67 
 
 		 254 aa  200  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.89 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.572139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.2 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0425767  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.6 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.72 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  44.49 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  44.53 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.53 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.2 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.31 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.96 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3364  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.56 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112135 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  39.11 
 
 		 251 aa  190  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2100  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.2 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.76 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.71 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5297  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.3 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4830  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.3 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5375  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.87 
 
 		 257 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.486184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.73 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362877  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  41.41 
 
 		 254 aa  185  8e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.1 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.04 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 		 251 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3510  putative chemotaxis protein MotA (flagellar motor component)  39.36 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.29 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1495  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.27 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00626739  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.46 
 
 		 262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.2 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  36.86 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.32 
 
 		 262 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.32 
 
 		 262 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.65 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.22 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.57 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.01 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0541  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  37.94 
 
 		 260 aa  161  8.000000000000001e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.07 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.2 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.63 
 
 		 265 aa  158  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  33.2 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.64 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.25 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.98 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.98 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.9 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.22 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.6 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.55 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  33.06 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1340  flagellar motor protein MotP  35.06 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  34.15 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.25 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1504  flagellar motor protein MotP  33.98 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  34.52 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.15 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0494  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.58 
 
 		 272 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.868711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>