274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1495 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1495  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00626739  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  96.11 
 
 		 257 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3510  putative chemotaxis protein MotA (flagellar motor component)  89.49 
 
 		 257 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  87.55 
 
 		 257 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  84.44 
 
 		 257 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2100  MotA/TolQ/ExbB proton channel  82.88 
 
 		 257 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3364  MotA/TolQ/ExbB proton channel  82.49 
 
 		 257 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.54 
 
 		 257 aa  352  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0425767  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.56 
 
 		 292 aa  343  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4830  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.11 
 
 		 272 aa  338  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5297  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.11 
 
 		 257 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5375  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.67 
 
 		 257 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.486184 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.84 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  39.36 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.6 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.8 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.19 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.572139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.76 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  40.64 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  41.25 
 
 		 255 aa  181  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  41.04 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  41.04 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  41.04 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  41.04 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  39.2 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  39.04 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  38.65 
 
 		 253 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  41.27 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  39.84 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.65 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.85 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  39.44 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  39.44 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38 
 
 		 253 aa  175  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  39.84 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  39.29 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.1 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  40.24 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  37.8 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  40 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  36.47 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.25 
 
 		 267 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  37.6 
 
 		 251 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  39.68 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  36.9 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.9 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  37.85 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  38.98 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.1 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  38.65 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  36.9 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  35.97 
 
 		 254 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  34.52 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.35 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.18 
 
 		 261 aa  155  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.25 
 
 		 266 aa  155  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.57 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.11 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.47 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.6 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.4 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.78 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.85 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.73 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.11 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.08 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.75 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.1 
 
 		 261 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.62 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.07 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.01 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.98 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.2 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  34.01 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.72 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.72 
 
 		 261 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  31.71 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.12 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.52 
 
 		 247 aa  132  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  32.95 
 
 		 255 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.13 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  29.27 
 
 		 246 aa  131  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  30.59 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  30.08 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  33.33 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1504  flagellar motor protein MotP  31.23 
 
 		 277 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.47 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.53 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1544  flagellar motor protein MotP  29.73 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.47 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1539  flagellar motor protein MotP  31.58 
 
 		 254 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1658  flagellar motor protein MotP  31.58 
 
 		 254 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.94 
 
 		 253 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  32.94 
 
 		 253 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  30.89 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.24 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.07 
 
 		 266 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>