283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3616 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 254 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5469  MotA/TolQ/ExbB proton channel  99.21 
 
 		 254 aa  497  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2359  MotA/TolQ/ExbB proton channel  97.24 
 
 		 254 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4630  MotA/TolQ/ExbB proton channel  96.46 
 
 		 254 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.220987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  96.46 
 
 		 254 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3787  MotA/TolQ/ExbB proton channel  96.06 
 
 		 254 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146883  normal  0.0197098 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4999  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.16 
 
 		 254 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.567523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4599  MotA/TolQ/ExbB proton channel  79.05 
 
 		 254 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.666334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1376  putative flagellar motor protein (MotA)  77.87 
 
 		 254 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  42.86 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1524  chemotaxis MotA protein  40.08 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  40.33 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  43.03 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  41.87 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  43.03 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  40.74 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  40.74 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  37.86 
 
 		 246 aa  181  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  40.74 
 
 		 246 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1949  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.62 
 
 		 246 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  40.74 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  40.57 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  41.15 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  40.57 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  40.74 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  40.74 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  40.98 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.76 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.93 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  36.61 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  40.57 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.93 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.08 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.27 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.93 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.5 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  37.45 
 
 		 246 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.45 
 
 		 247 aa  168  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  39.51 
 
 		 246 aa  168  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.63 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.08 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.19 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.1 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.21 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00026  flagellar motor protein  41.3 
 
 		 237 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  31.4 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.76 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2933  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.61 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.41 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.8 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.71 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.44 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.98 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.51 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  34.78 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.48 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.54 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.23 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.61 
 
 		 267 aa  138  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  32.37 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3423  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.55 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  31.95 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.35 
 
 		 266 aa  135  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  31.95 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.37 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.37 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0494  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.868711  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.69 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.92 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3364  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.99 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112135 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.97 
 
 		 272 aa  128  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  31.76 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2981  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.37 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.44999 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.99 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.12 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4287  chemotaxis motA protein  32.78 
 
 		 244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  31.4 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.81 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  31.09 
 
 		 255 aa  125  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2100  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.58 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  30.67 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5375  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.06 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.486184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  28.99 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.37 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  31.12 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.18 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.19 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  26.56 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  30.86 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.16 
 
 		 266 aa  122  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5297  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.21 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4830  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.21 
 
 		 272 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  31.51 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  29.25 
 
 		 255 aa  122  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.43 
 
 		 255 aa  121  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.36 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.572139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  29.75 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0749  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>