222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1072 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
274 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.433841  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2023  MotA/TolQ/ExbB proton channel  70.07 
 
 
277 aa  397  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0047774  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.65 
 
 
299 aa  301  8.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.08 
 
 
277 aa  299  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.921977  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.65 
 
 
301 aa  298  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27650  flagellar motor protein  55.69 
 
 
273 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133269  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1684  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.34 
 
 
272 aa  275  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.91 
 
 
267 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.59 
 
 
252 aa  158  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.46 
 
 
266 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.1 
 
 
252 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  34.68 
 
 
254 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  29.18 
 
 
251 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.62 
 
 
251 aa  143  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  34.92 
 
 
251 aa  141  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.29 
 
 
262 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.29 
 
 
262 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.85 
 
 
279 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.34 
 
 
267 aa  139  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.64 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.5 
 
 
272 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.43 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.52 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0358  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.94 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.49 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.26 
 
 
253 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.93 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.84 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  29.84 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  30.8 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  30.5 
 
 
253 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.97 
 
 
255 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  27.91 
 
 
257 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.75 
 
 
251 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  27.52 
 
 
257 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.83 
 
 
277 aa  122  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.62 
 
 
255 aa  122  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.572139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.71 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.55 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  28.51 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  31.08 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.09 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.92 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
251 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1495  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00626739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.7 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.98 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.7 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.21 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26 
 
 
254 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.41 
 
 
257 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2100  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.74 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.03 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.97 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.51 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.95 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3364  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0112135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.82 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.92 
 
 
265 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.15 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.34 
 
 
257 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0425767  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.59 
 
 
262 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  28.19 
 
 
254 aa  112  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.83 
 
 
257 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  22.8 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  28.86 
 
 
246 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.91 
 
 
288 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  30.48 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  28.24 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  28.86 
 
 
246 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  27.91 
 
 
253 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.6 
 
 
249 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  28.52 
 
 
254 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.91 
 
 
253 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  28.46 
 
 
246 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  28.46 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  28.98 
 
 
246 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2464  flagellar motor protein MotA  26.05 
 
 
263 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.407079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  28.05 
 
 
246 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  27.82 
 
 
245 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  28.86 
 
 
246 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  29.06 
 
 
254 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  26.92 
 
 
255 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2975  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.2 
 
 
285 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  27.86 
 
 
255 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  28.05 
 
 
246 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  27.2 
 
 
255 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.91 
 
 
253 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.66 
 
 
267 aa  106  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.41 
 
 
272 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  25.38 
 
 
255 aa  106  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  28.29 
 
 
253 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  26.34 
 
 
255 aa  106  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.93 
 
 
263 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3510  putative chemotaxis protein MotA (flagellar motor component)  26.97 
 
 
257 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1340  flagellar motor protein MotP  26.51 
 
 
277 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  25.56 
 
 
263 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.08 
 
 
246 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.03 
 
 
253 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.793002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>