More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2408 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  100 
 
 		 304 aa  610  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  82.53 
 
 		 306 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  57.74 
 
 		 303 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  58.82 
 
 		 300 aa  346  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  58.25 
 
 		 304 aa  341  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  58.56 
 
 		 299 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  58.56 
 
 		 300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.47 
 
 		 298 aa  336  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.33 
 
 		 300 aa  333  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.02 
 
 		 302 aa  331  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  56.45 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.33 
 
 		 297 aa  323  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  53.72 
 
 		 310 aa  315  4e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.88 
 
 		 297 aa  315  5e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.14 
 
 		 298 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.43 
 
 		 309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  54.82 
 
 		 298 aa  311  5.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  52 
 
 		 299 aa  308  5.9999999999999995e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  54.94 
 
 		 326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.38 
 
 		 309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  54.9 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  55.18 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.75 
 
 		 305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.77 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.77 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.77 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  52.16 
 
 		 298 aa  296  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  51.13 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.18 
 
 		 296 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  52.52 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.87 
 
 		 309 aa  288  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  52.22 
 
 		 312 aa  286  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.57 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  50.67 
 
 		 306 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  48.37 
 
 		 306 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.87 
 
 		 307 aa  258  8e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  46.03 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  49.5 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0147  ATP synthase F1, gamma subunit  42.73 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  40.47 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.06 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  40.97 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.38 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.94 
 
 		 281 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.51 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.71 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.71 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.71 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.71 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.71 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.71 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.71 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.16 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.71 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.16 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.71 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.37 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.12 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  38.67 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  39.12 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.07 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.16 
 
 		 315 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.21 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.85 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.21 
 
 		 288 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  37.04 
 
 		 292 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  37.87 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.87 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  37.79 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.85 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  38.52 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.85 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.33 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.47 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  36.54 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  40.07 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0563  ATP synthase F1, gamma subunit  37.85 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.071167  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.06 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_502  ATP synthase F1, gamma subunit  37.5 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00717942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.7 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.17 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.7 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0514  ATP synthase F1, gamma subunit  33.22 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  33.89 
 
 		 286 aa  169  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12060  ATP synthase, F1 gamma subunit  35.71 
 
 		 308 aa  169  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.67 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0175  ATP synthase F1, gamma subunit  32.57 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.314705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.8 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.48 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1404  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.13 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.36 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1044  ATP synthase F1, gamma subunit  36.12 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.129689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21410  ATP synthase, F1 gamma subunit  34.98 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3285  ATP synthase F1, gamma subunit  37.93 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  34.69 
 
 		 315 aa  166  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>