More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2618 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
314 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  79.3 
 
 
314 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  79.3 
 
 
314 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  75.8 
 
 
315 aa  495  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  76.75 
 
 
315 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  75.16 
 
 
315 aa  492  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  72.93 
 
 
316 aa  472  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.66 
 
 
314 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.44 
 
 
316 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0489  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.42 
 
 
317 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0980  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.34 
 
 
316 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15691  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.03 
 
 
316 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18481  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.03 
 
 
316 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.672263 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04841  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.1 
 
 
316 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20657  precursor of ATPase ATPase gamma subunit  57.93 
 
 
369 aa  365  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363655  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.46 
 
 
316 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16291  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.83 
 
 
316 aa  363  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16521  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.51 
 
 
316 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.51 
 
 
316 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.198196  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24766  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  56.11 
 
 
365 aa  361  9e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.057416  normal  0.404649 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.08 
 
 
282 aa  225  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 
286 aa  220  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.45 
 
 
287 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.45 
 
 
287 aa  219  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 
286 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.32 
 
 
283 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 
286 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 
286 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 
286 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
286 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.9 
 
 
286 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.85 
 
 
288 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.22 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.78 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.78 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  41.74 
 
 
309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.78 
 
 
286 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.78 
 
 
286 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.87 
 
 
295 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.78 
 
 
286 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.92 
 
 
298 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.49 
 
 
281 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 
288 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 
286 aa  210  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  38.76 
 
 
287 aa  210  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.31 
 
 
288 aa  209  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  42.04 
 
 
287 aa  209  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2326  ATP synthase F1, gamma subunit  37.1 
 
 
286 aa  209  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0244217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.76 
 
 
283 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  37.46 
 
 
290 aa  209  6e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.22 
 
 
287 aa  209  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.17 
 
 
287 aa  209  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.63 
 
 
291 aa  208  9e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.19 
 
 
289 aa  208  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.99 
 
 
288 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 
286 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.26 
 
 
287 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 
286 aa  206  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 
289 aa  206  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 
287 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 
287 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 
287 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 
287 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 
287 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.32 
 
 
289 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 
287 aa  205  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 
287 aa  205  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 
287 aa  205  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 
287 aa  205  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 
287 aa  205  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  38.56 
 
 
304 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  36.62 
 
 
286 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.26 
 
 
288 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  36.67 
 
 
310 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.29 
 
 
285 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.85 
 
 
287 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
291 aa  204  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1026  ATP synthase F1, gamma subunit  36.31 
 
 
295 aa  204  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 
287 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.22 
 
 
287 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  40.84 
 
 
299 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.14 
 
 
287 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 
287 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  36.51 
 
 
287 aa  202  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 
287 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 
287 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 
287 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  36.51 
 
 
287 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 
287 aa  202  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 
287 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  38.44 
 
 
326 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.62 
 
 
286 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.39 
 
 
293 aa  202  6e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.19 
 
 
286 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 
287 aa  202  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  36.62 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>