More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3951 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
309 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
309 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
309 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  76.8 
 
 
305 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  84.09 
 
 
309 aa  455  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  82.79 
 
 
309 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  64.59 
 
 
311 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  62.04 
 
 
326 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  63.31 
 
 
312 aa  381  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  59.87 
 
 
310 aa  361  9e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  58.44 
 
 
306 aa  352  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.65 
 
 
309 aa  338  7e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.28 
 
 
309 aa  334  9e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.87 
 
 
298 aa  332  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  56.35 
 
 
312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  53.25 
 
 
303 aa  311  9e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  52.01 
 
 
299 aa  308  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  55.41 
 
 
308 aa  308  6.999999999999999e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  52.06 
 
 
304 aa  295  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  51.34 
 
 
300 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  52.46 
 
 
306 aa  292  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  50.32 
 
 
300 aa  292  6e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.45 
 
 
302 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.99 
 
 
297 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.1 
 
 
298 aa  288  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  50.32 
 
 
298 aa  285  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.86 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  48.28 
 
 
310 aa  279  5e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  49.35 
 
 
298 aa  276  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  46.91 
 
 
299 aa  271  8.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.18 
 
 
296 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  51.83 
 
 
304 aa  269  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  47.21 
 
 
297 aa  269  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.64 
 
 
300 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  45.98 
 
 
306 aa  255  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  44.37 
 
 
304 aa  246  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  45.18 
 
 
298 aa  243  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.18 
 
 
307 aa  234  9e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.73 
 
 
283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0147  ATP synthase F1, gamma subunit  37.24 
 
 
334 aa  207  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  37.54 
 
 
291 aa  205  8e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.42 
 
 
285 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.75 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.74 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.75 
 
 
282 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.96 
 
 
283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  36.33 
 
 
299 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  35.53 
 
 
287 aa  192  8e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.1 
 
 
288 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.44 
 
 
288 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.42 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.44 
 
 
288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.42 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  37.42 
 
 
288 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  34.09 
 
 
291 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  36.49 
 
 
290 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.1 
 
 
287 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  35.48 
 
 
295 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.74 
 
 
286 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.74 
 
 
286 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.97 
 
 
286 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.08 
 
 
286 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.75 
 
 
288 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.97 
 
 
286 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.97 
 
 
286 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.97 
 
 
286 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.97 
 
 
286 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.97 
 
 
286 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.77 
 
 
288 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.77 
 
 
288 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.97 
 
 
286 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.97 
 
 
286 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.97 
 
 
286 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.97 
 
 
286 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.47 
 
 
286 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.46 
 
 
286 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.29 
 
 
286 aa  186  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  33.44 
 
 
308 aa  185  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  38.69 
 
 
286 aa  185  9e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3285  ATP synthase F1, gamma subunit  38.56 
 
 
292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.1 
 
 
298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.82 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.33 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  36.21 
 
 
287 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  37.17 
 
 
287 aa  183  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.08 
 
 
286 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  38.87 
 
 
286 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
293 aa  182  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.1 
 
 
286 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.2 
 
 
293 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.57 
 
 
293 aa  181  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  33.55 
 
 
286 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0011  ATP synthase F1, gamma subunit  37.09 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.45 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12060  ATP synthase, F1 gamma subunit  35.31 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.31 
 
 
291 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  33.85 
 
 
309 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.56 
 
 
289 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
290 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.66 
 
 
315 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>