More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0514 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0514  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
294 aa  599  1e-170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1737  F0F1 ATP synthase subunit gamma  75.25 
 
 
295 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.371278  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0916  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.9 
 
 
295 aa  448  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00701907  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1526  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.96 
 
 
295 aa  429  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000258594  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  66.22 
 
 
294 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.54 
 
 
294 aa  395  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.031727  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  66.55 
 
 
294 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0150895  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  63.85 
 
 
294 aa  387  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000126351  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0686  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.65 
 
 
296 aa  375  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0122169  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1404  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.81 
 
 
295 aa  362  3e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.32 
 
 
287 aa  200  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.07 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.71 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.8 
 
 
287 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 
287 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  38.64 
 
 
305 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.7 
 
 
291 aa  193  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.85 
 
 
288 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.33 
 
 
287 aa  192  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.03 
 
 
290 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.58 
 
 
282 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.49 
 
 
289 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.15 
 
 
289 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.57 
 
 
295 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.69 
 
 
290 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.05 
 
 
290 aa  188  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.69 
 
 
291 aa  188  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.49 
 
 
288 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  35.08 
 
 
295 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 
291 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.49 
 
 
291 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.49 
 
 
290 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  38.38 
 
 
293 aa  185  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.67 
 
 
288 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.76 
 
 
287 aa  185  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.67 
 
 
288 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.31 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  39.1 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  36.82 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.05 
 
 
281 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  33.97 
 
 
309 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  36.7 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.58 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.79 
 
 
287 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.71 
 
 
288 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.71 
 
 
288 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.25 
 
 
290 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.9 
 
 
295 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.02 
 
 
283 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.79 
 
 
287 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  33.79 
 
 
287 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.79 
 
 
287 aa  176  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.11 
 
 
287 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.79 
 
 
287 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.79 
 
 
287 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.09 
 
 
293 aa  176  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.79 
 
 
287 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.79 
 
 
287 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  33.79 
 
 
287 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  33.45 
 
 
287 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.79 
 
 
287 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.13 
 
 
287 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  37.33 
 
 
287 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.13 
 
 
287 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.13 
 
 
287 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.13 
 
 
287 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.13 
 
 
287 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
289 aa  175  8e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 
290 aa  175  8e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.56 
 
 
295 aa  175  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  34.35 
 
 
285 aa  175  9e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.76 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0371  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.14 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0039  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.9 
 
 
294 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0292882  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.36 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  33.56 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3895  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.9 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476165  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21410  ATP synthase, F1 gamma subunit  34.3 
 
 
303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.740846  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.1 
 
 
286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.59 
 
 
291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33 
 
 
287 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.15 
 
 
291 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.33 
 
 
287 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.49 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.35 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.69 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25752  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.4 
 
 
286 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.68 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1299  ATP synthase F1, gamma subunit  32.58 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.64186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3527  ATP synthase F1, gamma subunit  33.45 
 
 
293 aa  172  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0286312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.52 
 
 
286 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4871  ATP synthase F1, gamma subunit  35.74 
 
 
291 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.87 
 
 
287 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0419  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.52 
 
 
290 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>