More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1762 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.2 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  61.61 
 
 		 310 aa  363  3e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.02 
 
 		 297 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  60.47 
 
 		 297 aa  349  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  59.6 
 
 		 299 aa  348  4e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  58.45 
 
 		 298 aa  343  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  57.72 
 
 		 298 aa  342  4e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.49 
 
 		 296 aa  341  7e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.38 
 
 		 297 aa  338  7e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  58.63 
 
 		 304 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.78 
 
 		 298 aa  330  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  55.7 
 
 		 311 aa  326  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  57 
 
 		 306 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.72 
 
 		 309 aa  322  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.39 
 
 		 300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.08 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  54.61 
 
 		 300 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  57.93 
 
 		 299 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.72 
 
 		 298 aa  311  9e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  57.09 
 
 		 304 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.27 
 
 		 309 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.27 
 
 		 309 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.27 
 
 		 309 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  57.24 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  52.78 
 
 		 326 aa  298  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.65 
 
 		 305 aa  296  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  54.39 
 
 		 298 aa  285  5.999999999999999e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  50 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  48.49 
 
 		 304 aa  276  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.77 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  50.96 
 
 		 312 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.13 
 
 		 309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  49.03 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.75 
 
 		 307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  48.01 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  47.63 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  48.86 
 
 		 306 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0147  ATP synthase F1, gamma subunit  41.3 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.69 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 		 286 aa  205  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.02 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.59 
 
 		 288 aa  202  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.59 
 
 		 288 aa  202  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.22 
 
 		 281 aa  202  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  39.07 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.62 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.43 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.2 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.14 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  35.02 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.88 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  36.99 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  39.3 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.27 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.25 
 
 		 289 aa  189  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  37.5 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  37.62 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  39.66 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.52 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  37.71 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 		 290 aa  187  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0175  ATP synthase F1, gamma subunit  35.84 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.99 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.37 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1044  ATP synthase F1, gamma subunit  37.54 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.129689 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.9 
 
 		 287 aa  182  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.49 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  37.54 
 
 		 287 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.79 
 
 		 283 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.55 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.05 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.42 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.72 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  39.32 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0039  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.12 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0292882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.35 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.62 
 
 		 287 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1299  ATP synthase F1, gamma subunit  33.99 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.64186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3895  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.12 
 
 		 294 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.35 
 
 		 287 aa  178  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.59 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  35.42 
 
 		 315 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.11 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.29 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.11 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.45 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>