More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1920 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 		 310 aa  627  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  74.6 
 
 		 306 aa  461  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  66.12 
 
 		 312 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  62.66 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.87 
 
 		 309 aa  351  7e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.87 
 
 		 309 aa  351  7e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.87 
 
 		 309 aa  351  7e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.9 
 
 		 305 aa  350  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.46 
 
 		 309 aa  335  7e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.46 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  56.87 
 
 		 312 aa  323  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  57.45 
 
 		 326 aa  323  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.75 
 
 		 298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  58.77 
 
 		 308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.57 
 
 		 309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.57 
 
 		 309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  53.53 
 
 		 304 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  51.5 
 
 		 299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  50.65 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  52.82 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  49.37 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.09 
 
 		 298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  51.97 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.3 
 
 		 302 aa  273  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  48.52 
 
 		 299 aa  271  8.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.12 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  49.03 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  50.66 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  48.04 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  47.21 
 
 		 298 aa  263  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.21 
 
 		 297 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  47.42 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  47.54 
 
 		 297 aa  258  9e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.28 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.22 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.56 
 
 		 286 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.56 
 
 		 286 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.91 
 
 		 283 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.29 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.29 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  44.3 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.26 
 
 		 286 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.94 
 
 		 286 aa  225  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.58 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.29 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.29 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.94 
 
 		 287 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.73 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  40.78 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.61 
 
 		 286 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.81 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.96 
 
 		 286 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  39.61 
 
 		 286 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.29 
 
 		 291 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.29 
 
 		 291 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  36.69 
 
 		 291 aa  219  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  38.41 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.31 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.99 
 
 		 288 aa  216  5e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.04 
 
 		 289 aa  216  5e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.31 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.89 
 
 		 293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.94 
 
 		 282 aa  215  9e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.66 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.96 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.66 
 
 		 287 aa  212  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.04 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.66 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.66 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.66 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.66 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.66 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.66 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.48 
 
 		 295 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.31 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0039  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.92 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0292882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.34 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  37.34 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.74 
 
 		 293 aa  210  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.66 
 
 		 291 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3895  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.92 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.34 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  37.34 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.34 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.25 
 
 		 289 aa  209  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.34 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.34 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.34 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.31 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.99 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>