More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4113 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
286 aa  587  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.36 
 
 
289 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0371  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.49 
 
 
288 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3895  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.05 
 
 
294 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476165  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.73 
 
 
291 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.66 
 
 
290 aa  421  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  69.76 
 
 
291 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0039  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.71 
 
 
294 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0292882  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.04 
 
 
291 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0196  Sodium-transporting two-sector ATPase  70 
 
 
291 aa  421  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.73 
 
 
291 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.04 
 
 
291 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  67.7 
 
 
291 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.07 
 
 
291 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.73 
 
 
291 aa  417  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0307  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.1 
 
 
288 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2950  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.07 
 
 
291 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0738398  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0121  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.07 
 
 
291 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0096  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.73 
 
 
291 aa  417  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.07 
 
 
291 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25752  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.07 
 
 
291 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506697  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0302  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.1 
 
 
288 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73388  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2956  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.38 
 
 
291 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0180  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.38 
 
 
291 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3014  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.38 
 
 
291 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4043  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.38 
 
 
291 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3527  ATP synthase F1, gamma subunit  67.81 
 
 
293 aa  414  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0286312 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1588  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.38 
 
 
291 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3969  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.38 
 
 
291 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0326  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.44 
 
 
288 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  67.8 
 
 
295 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3356  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.38 
 
 
291 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.04 
 
 
291 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00792129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0254  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.06 
 
 
288 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85484  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0419  F0F1 ATP synthase subunit gamma  67.93 
 
 
290 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  66.21 
 
 
293 aa  408  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0107  ATP synthase F1, gamma subunit  65.2 
 
 
298 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0013955  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4871  ATP synthase F1, gamma subunit  66.08 
 
 
291 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0479  ATP synthase F1, gamma subunit  65.37 
 
 
291 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658838  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.94 
 
 
289 aa  371  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.63 
 
 
289 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  58.97 
 
 
289 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.09 
 
 
288 aa  347  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.09 
 
 
288 aa  347  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.75 
 
 
287 aa  341  8e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.59 
 
 
286 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.59 
 
 
286 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.59 
 
 
286 aa  339  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  57.34 
 
 
286 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  56.64 
 
 
286 aa  337  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.29 
 
 
286 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  54.9 
 
 
286 aa  336  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  55.21 
 
 
288 aa  336  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.4 
 
 
289 aa  335  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.21 
 
 
288 aa  335  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.63 
 
 
289 aa  335  5.999999999999999e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.94 
 
 
286 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.94 
 
 
286 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.31 
 
 
287 aa  334  7.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.55 
 
 
286 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.55 
 
 
286 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.59 
 
 
286 aa  334  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.55 
 
 
286 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.29 
 
 
286 aa  334  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.55 
 
 
286 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.1 
 
 
287 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  56.1 
 
 
287 aa  333  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.55 
 
 
286 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.1 
 
 
287 aa  333  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.1 
 
 
287 aa  333  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.1 
 
 
287 aa  333  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.85 
 
 
286 aa  333  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  56.1 
 
 
287 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.1 
 
 
287 aa  333  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.1 
 
 
287 aa  333  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.1 
 
 
287 aa  332  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.05 
 
 
287 aa  332  6e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.51 
 
 
288 aa  331  8e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.9 
 
 
286 aa  330  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.17 
 
 
288 aa  330  1e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.17 
 
 
288 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.75 
 
 
287 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.9 
 
 
286 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.75 
 
 
287 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.75 
 
 
287 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.75 
 
 
287 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.75 
 
 
287 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.4 
 
 
287 aa  329  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.24 
 
 
286 aa  329  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.79 
 
 
287 aa  329  4e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.85 
 
 
286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.85 
 
 
286 aa  326  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  53.15 
 
 
287 aa  326  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.85 
 
 
287 aa  325  4.0000000000000003e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.45 
 
 
287 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.75 
 
 
287 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.75 
 
 
287 aa  325  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.74 
 
 
293 aa  325  5e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.5 
 
 
286 aa  325  5e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.96 
 
 
287 aa  325  6e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>