More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0335 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
306 aa  615  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  82.53 
 
 
304 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  59.09 
 
 
300 aa  348  8e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  57.65 
 
 
303 aa  342  4e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.41 
 
 
297 aa  338  8e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  56.91 
 
 
304 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.48 
 
 
302 aa  332  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.91 
 
 
300 aa  329  4e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  56.41 
 
 
311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.1 
 
 
298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  56.12 
 
 
299 aa  326  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  58.16 
 
 
300 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.52 
 
 
297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.89 
 
 
309 aa  315  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  54.97 
 
 
299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  55.56 
 
 
326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  54.69 
 
 
310 aa  311  6.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.63 
 
 
309 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  55.37 
 
 
308 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  53.97 
 
 
298 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.11 
 
 
298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.48 
 
 
296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.75 
 
 
309 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.75 
 
 
309 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.75 
 
 
309 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  54.82 
 
 
306 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  53.49 
 
 
297 aa  296  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  52.41 
 
 
310 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  50.82 
 
 
298 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  50.94 
 
 
312 aa  288  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.84 
 
 
305 aa  285  8e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  52.81 
 
 
312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.21 
 
 
309 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.58 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  47.73 
 
 
306 aa  272  5.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  49.17 
 
 
298 aa  266  5e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  44.92 
 
 
304 aa  249  6e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.56 
 
 
307 aa  246  3e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0147  ATP synthase F1, gamma subunit  40.3 
 
 
334 aa  229  4e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  41 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.67 
 
 
281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  38.8 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.46 
 
 
285 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 
288 aa  191  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 
288 aa  191  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  40.8 
 
 
287 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.26 
 
 
285 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.91 
 
 
288 aa  189  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.33 
 
 
283 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.67 
 
 
283 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  38.97 
 
 
290 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.96 
 
 
298 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.75 
 
 
286 aa  185  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  38.41 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.09 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.09 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.09 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.09 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.09 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.09 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.09 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.42 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.09 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.09 
 
 
286 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 
286 aa  182  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.8 
 
 
315 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  37.07 
 
 
288 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  35.31 
 
 
292 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.91 
 
 
315 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.78 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.59 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.9 
 
 
288 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.9 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.88 
 
 
293 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_002936  DET0563  ATP synthase F1, gamma subunit  37.46 
 
 
285 aa  170  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.071167  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  36.14 
 
 
291 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.78 
 
 
293 aa  170  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0175  ATP synthase F1, gamma subunit  33.99 
 
 
297 aa  170  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.12 
 
 
290 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.57 
 
 
290 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.76 
 
 
286 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_502  ATP synthase F1, gamma subunit  37.46 
 
 
285 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00717942  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  39.26 
 
 
287 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.35 
 
 
288 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.76 
 
 
286 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
286 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  33.89 
 
 
291 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.88 
 
 
286 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.49 
 
 
287 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.88 
 
 
286 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.41 
 
 
286 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.46 
 
 
289 aa  166  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.06 
 
 
316 aa  166  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  35.88 
 
 
287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.58 
 
 
289 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  36.13 
 
 
309 aa  165  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.2 
 
 
286 aa  165  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.54 
 
 
287 aa  165  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.14 
 
 
293 aa  165  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>