More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4166 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.96 
 
 
283 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  57.29 
 
 
295 aa  348  5e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  55.59 
 
 
287 aa  330  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.34 
 
 
281 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.89 
 
 
298 aa  298  8e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50 
 
 
282 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.13 
 
 
287 aa  266  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.13 
 
 
287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  47.64 
 
 
291 aa  262  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.78 
 
 
287 aa  262  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  47.35 
 
 
287 aa  260  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  43.77 
 
 
345 aa  259  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.17 
 
 
290 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.45 
 
 
286 aa  257  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.22 
 
 
288 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.76 
 
 
286 aa  256  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.21 
 
 
289 aa  256  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.69 
 
 
287 aa  255  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  45.33 
 
 
288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.69 
 
 
287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
286 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
286 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
286 aa  253  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.18 
 
 
288 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.18 
 
 
288 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.98 
 
 
288 aa  252  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.06 
 
 
286 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.06 
 
 
286 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.75 
 
 
286 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.06 
 
 
286 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.06 
 
 
286 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.6 
 
 
286 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.6 
 
 
286 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.6 
 
 
286 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.6 
 
 
286 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.6 
 
 
286 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.6 
 
 
286 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.6 
 
 
286 aa  250  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.6 
 
 
286 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.6 
 
 
286 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.94 
 
 
286 aa  249  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.7 
 
 
291 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.06 
 
 
286 aa  248  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.25 
 
 
288 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.71 
 
 
286 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.71 
 
 
286 aa  247  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  41.61 
 
 
287 aa  246  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.79 
 
 
290 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.4 
 
 
288 aa  244  8e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  43.25 
 
 
289 aa  244  9e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.79 
 
 
290 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.94 
 
 
289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  47.04 
 
 
287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.01 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.31 
 
 
286 aa  243  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  43.01 
 
 
286 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.31 
 
 
286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.46 
 
 
287 aa  242  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.9 
 
 
289 aa  242  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.66 
 
 
287 aa  241  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  44.06 
 
 
286 aa  241  7e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.46 
 
 
287 aa  241  7.999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.44 
 
 
290 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.61 
 
 
286 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.96 
 
 
286 aa  240  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.96 
 
 
286 aa  240  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.46 
 
 
287 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.91 
 
 
289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.91 
 
 
289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.03 
 
 
289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.02 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.14 
 
 
290 aa  239  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3967  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.01 
 
 
286 aa  239  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0127886  normal  0.423609 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.48 
 
 
291 aa  239  5e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.38 
 
 
288 aa  238  8e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.64 
 
 
293 aa  238  9e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.61 
 
 
286 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.38 
 
 
288 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  42.9 
 
 
308 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.69 
 
 
290 aa  237  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.77 
 
 
287 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.77 
 
 
287 aa  237  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.77 
 
 
287 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.02 
 
 
288 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.46 
 
 
287 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.62 
 
 
287 aa  235  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.42 
 
 
287 aa  234  8e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  40.42 
 
 
287 aa  234  8e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.42 
 
 
287 aa  234  8e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.42 
 
 
287 aa  234  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.42 
 
 
287 aa  234  8e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  40.42 
 
 
287 aa  234  8e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.42 
 
 
287 aa  234  8e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.42 
 
 
287 aa  234  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.88 
 
 
295 aa  235  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.42 
 
 
287 aa  234  8e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.07 
 
 
287 aa  234  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.62 
 
 
288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>