More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0605 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 		 288 aa  597  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  84.48 
 
 		 288 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.14 
 
 		 288 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.1 
 
 		 287 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.06 
 
 		 287 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  67.36 
 
 		 287 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.97 
 
 		 287 aa  381  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.62 
 
 		 287 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.71 
 
 		 288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.71 
 
 		 288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.55 
 
 		 290 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.55 
 
 		 290 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.52 
 
 		 290 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.38 
 
 		 289 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  44.22 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  44.93 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  44.66 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  44.37 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  41.08 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.02 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.49 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  44.48 
 
 		 294 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.18 
 
 		 290 aa  242  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.79 
 
 		 281 aa  242  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  42.66 
 
 		 286 aa  241  7.999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.54 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.02 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.18 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  42.81 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.56 
 
 		 289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  41.78 
 
 		 309 aa  229  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.3 
 
 		 291 aa  229  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  37.75 
 
 		 345 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.14 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  39.38 
 
 		 289 aa  225  6e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.44 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.57 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.91 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.1 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  43.73 
 
 		 287 aa  219  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  39.45 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.18 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.12 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.57 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43 
 
 		 291 aa  215  5e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.81 
 
 		 291 aa  215  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.39 
 
 		 292 aa  215  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.46 
 
 		 315 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.98 
 
 		 293 aa  214  9e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  43.24 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.48 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.21 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.28 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  44.9 
 
 		 294 aa  212  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 		 292 aa  212  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.96 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.93 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  42.09 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.02 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.1 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.82 
 
 		 291 aa  208  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.47 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  39.81 
 
 		 315 aa  208  7e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.52 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.43 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.43 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.31 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.19 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.67 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  40.14 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.54 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.26 
 
 		 293 aa  205  5e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  38.23 
 
 		 285 aa  205  8e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1800  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.76 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907814  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.2 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.55 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1733  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.76 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.341678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.49 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.9 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.19 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1680  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.1 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0172  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0175  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.05 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.72 
 
 		 288 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.65 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>