More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3204 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 		 288 aa  587  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 		 288 aa  587  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0307  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.42 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0371  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.76 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0302  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.42 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73388  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.89 
 
 		 291 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  59.52 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0419  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.03 
 
 		 290 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  60.42 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.82 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.82 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0196  Sodium-transporting two-sector ATPase  59.66 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.97 
 
 		 290 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0254  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.33 
 
 		 288 aa  364  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  56.94 
 
 		 287 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.14 
 
 		 291 aa  361  6e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2956  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.79 
 
 		 291 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0180  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.79 
 
 		 291 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1588  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.79 
 
 		 291 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3969  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.79 
 
 		 291 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  57.64 
 
 		 288 aa  359  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3356  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.79 
 
 		 291 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3014  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.79 
 
 		 291 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.79 
 
 		 291 aa  359  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0326  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.33 
 
 		 288 aa  359  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.79 
 
 		 291 aa  359  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00792129  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.9 
 
 		 288 aa  358  5e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4043  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.45 
 
 		 291 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.17 
 
 		 287 aa  358  5e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.11 
 
 		 291 aa  358  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.94 
 
 		 287 aa  358  7e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.94 
 
 		 288 aa  358  7e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.11 
 
 		 291 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.6 
 
 		 287 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  59.03 
 
 		 286 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.76 
 
 		 291 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0096  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.76 
 
 		 291 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0121  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.76 
 
 		 291 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2950  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.76 
 
 		 291 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0738398  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.76 
 
 		 291 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506697  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  56.36 
 
 		 286 aa  353  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.13 
 
 		 289 aa  352  5e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3527  ATP synthase F1, gamma subunit  57.09 
 
 		 293 aa  351  7e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0286312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.04 
 
 		 286 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.04 
 
 		 286 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.94 
 
 		 287 aa  350  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.6 
 
 		 286 aa  349  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.29 
 
 		 295 aa  348  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.21 
 
 		 288 aa  348  5e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.94 
 
 		 286 aa  348  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.21 
 
 		 288 aa  348  8e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.17 
 
 		 288 aa  348  8e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.09 
 
 		 286 aa  347  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.13 
 
 		 286 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.56 
 
 		 286 aa  347  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.25 
 
 		 286 aa  347  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.25 
 
 		 286 aa  347  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.47 
 
 		 287 aa  346  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0039  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.48 
 
 		 294 aa  346  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0292882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.21 
 
 		 287 aa  346  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.9 
 
 		 286 aa  346  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3895  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.48 
 
 		 294 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476165  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.98 
 
 		 287 aa  345  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  53.98 
 
 		 287 aa  345  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.98 
 
 		 287 aa  345  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  53.98 
 
 		 287 aa  345  4e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.98 
 
 		 287 aa  345  4e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.79 
 
 		 286 aa  345  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.98 
 
 		 287 aa  345  4e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.09 
 
 		 289 aa  345  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.82 
 
 		 287 aa  345  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.98 
 
 		 287 aa  345  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.98 
 
 		 287 aa  345  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.98 
 
 		 287 aa  345  4e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.82 
 
 		 287 aa  345  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.44 
 
 		 286 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.51 
 
 		 287 aa  344  8.999999999999999e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.44 
 
 		 286 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.98 
 
 		 287 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.98 
 
 		 287 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.98 
 
 		 287 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.79 
 
 		 286 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.98 
 
 		 287 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.6 
 
 		 286 aa  344  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.98 
 
 		 287 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  57.44 
 
 		 286 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  56.7 
 
 		 291 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0479  ATP synthase F1, gamma subunit  56.23 
 
 		 291 aa  342  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.67 
 
 		 287 aa  342  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.17 
 
 		 287 aa  342  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.17 
 
 		 287 aa  342  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.17 
 
 		 287 aa  342  5e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0107  ATP synthase F1, gamma subunit  53.38 
 
 		 298 aa  342  5e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0013955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.44 
 
 		 286 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4871  ATP synthase F1, gamma subunit  55.87 
 
 		 291 aa  341  7e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.21 
 
 		 286 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.21 
 
 		 286 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.21 
 
 		 286 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.21 
 
 		 286 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.86 
 
 		 286 aa  339  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>