More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2704 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
291 aa  598  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  83.39 
 
 
291 aa  501  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  80.41 
 
 
291 aa  489  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  77.32 
 
 
290 aa  461  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  78.55 
 
 
292 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  77.32 
 
 
293 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.86 
 
 
295 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  51.15 
 
 
309 aa  299  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  46.44 
 
 
295 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  48.12 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  47.4 
 
 
294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  47.96 
 
 
297 aa  267  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  46.94 
 
 
294 aa  263  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.24 
 
 
287 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.52 
 
 
289 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.24 
 
 
287 aa  258  8e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.9 
 
 
287 aa  258  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.26 
 
 
287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.86 
 
 
288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.05 
 
 
287 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.08 
 
 
283 aa  248  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.39 
 
 
290 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.64 
 
 
281 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 
290 aa  241  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 
290 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.67 
 
 
282 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43 
 
 
289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.48 
 
 
283 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.24 
 
 
290 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.3 
 
 
290 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.18 
 
 
288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
291 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  42.47 
 
 
286 aa  229  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.52 
 
 
298 aa  228  7e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  37.8 
 
 
290 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  39.2 
 
 
345 aa  225  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  40.14 
 
 
289 aa  224  9e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.52 
 
 
299 aa  219  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2830  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.73 
 
 
293 aa  218  6e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 
294 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  40.48 
 
 
287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.33 
 
 
292 aa  212  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12060  ATP synthase, F1 gamma subunit  39.12 
 
 
308 aa  211  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.06 
 
 
285 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  38.82 
 
 
295 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 
298 aa  209  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.57 
 
 
292 aa  208  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.67 
 
 
291 aa  208  7e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  39.87 
 
 
305 aa  207  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.42 
 
 
288 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.42 
 
 
288 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.14 
 
 
290 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  40 
 
 
292 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.06 
 
 
285 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.18 
 
 
290 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  41.3 
 
 
287 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
314 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.14 
 
 
296 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.14 
 
 
291 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.05 
 
 
295 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.97 
 
 
290 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1737  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.05 
 
 
295 aa  202  4e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.371278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  39.73 
 
 
287 aa  202  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.02 
 
 
286 aa  202  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.68 
 
 
286 aa  202  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.68 
 
 
286 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.68 
 
 
286 aa  202  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.68 
 
 
286 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.68 
 
 
286 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.68 
 
 
286 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.68 
 
 
286 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.68 
 
 
286 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1710  ATP synthase F1, gamma subunit  42.75 
 
 
270 aa  201  9e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.68 
 
 
286 aa  201  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.8 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.25 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.66 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.68 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.06 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21410  ATP synthase, F1 gamma subunit  37.91 
 
 
303 aa  199  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.740846  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1044  ATP synthase F1, gamma subunit  38.69 
 
 
302 aa  199  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.129689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.34 
 
 
315 aa  198  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.46 
 
 
286 aa  198  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.53 
 
 
296 aa  198  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  35.54 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.07 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  36.34 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.86 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.58 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.94 
 
 
293 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.05 
 
 
295 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 
291 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.6 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  36.79 
 
 
291 aa  195  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.52 
 
 
289 aa  195  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1557  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.13 
 
 
292 aa  195  8.000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  38.78 
 
 
292 aa  195  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.06 
 
 
291 aa  195  9e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>