More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2383 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
298 aa  603  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.22 
 
 
281 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.14 
 
 
283 aa  311  9e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.89 
 
 
283 aa  298  8e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  51.69 
 
 
295 aa  295  6e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  52.41 
 
 
287 aa  289  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.68 
 
 
282 aa  278  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  47.28 
 
 
287 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.6 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  43.93 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.1 
 
 
290 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.85 
 
 
295 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.39 
 
 
287 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  47.5 
 
 
291 aa  240  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  45.39 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 
288 aa  238  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  43.84 
 
 
288 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.24 
 
 
290 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.05 
 
 
287 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.73 
 
 
295 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 
289 aa  236  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.18 
 
 
291 aa  235  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.36 
 
 
288 aa  235  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.21 
 
 
290 aa  234  9e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.2 
 
 
288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.79 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.88 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.03 
 
 
293 aa  232  5e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.66 
 
 
287 aa  232  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
290 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
290 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.71 
 
 
287 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.86 
 
 
288 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.86 
 
 
288 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.77 
 
 
291 aa  231  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  45.42 
 
 
295 aa  230  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.92 
 
 
289 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
287 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
287 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
287 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 
291 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.34 
 
 
286 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
287 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
287 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  44.3 
 
 
309 aa  229  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.62 
 
 
298 aa  229  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.97 
 
 
289 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.15 
 
 
287 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 
287 aa  229  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.73 
 
 
286 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.15 
 
 
286 aa  229  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.96 
 
 
293 aa  229  6e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 
287 aa  228  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  41.36 
 
 
287 aa  228  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 
287 aa  228  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.27 
 
 
293 aa  228  7e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  41.36 
 
 
287 aa  228  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 
287 aa  228  7e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 
287 aa  228  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.52 
 
 
291 aa  228  7e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 
287 aa  228  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 
287 aa  228  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.79 
 
 
289 aa  228  8e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 
291 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 
291 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.78 
 
 
287 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_502  ATP synthase F1, gamma subunit  44.68 
 
 
285 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00717942  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
286 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 
287 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.88 
 
 
289 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.78 
 
 
287 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.78 
 
 
287 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 
291 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.94 
 
 
286 aa  227  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 
287 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.79 
 
 
287 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  44.26 
 
 
292 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.22 
 
 
286 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.22 
 
 
286 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.22 
 
 
286 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.22 
 
 
286 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.22 
 
 
286 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.22 
 
 
286 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.05 
 
 
286 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.22 
 
 
286 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.22 
 
 
286 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 
287 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.22 
 
 
286 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 
287 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.22 
 
 
286 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.78 
 
 
287 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.75 
 
 
289 aa  226  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.52 
 
 
295 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.15 
 
 
286 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.15 
 
 
286 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.15 
 
 
286 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.71 
 
 
286 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.15 
 
 
286 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
286 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  42.21 
 
 
287 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>