More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1266 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 		 290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  97.59 
 
 		 290 aa  570  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.79 
 
 		 290 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.16 
 
 		 295 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  57.53 
 
 		 291 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  50.52 
 
 		 285 aa  279  3e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0563  ATP synthase F1, gamma subunit  50.18 
 
 		 285 aa  265  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.071167  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_502  ATP synthase F1, gamma subunit  49.46 
 
 		 285 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00717942  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.9 
 
 		 288 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.9 
 
 		 288 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.7 
 
 		 289 aa  248  7e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.04 
 
 		 281 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.03 
 
 		 288 aa  244  8e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.03 
 
 		 288 aa  245  8e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.33 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.94 
 
 		 287 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.75 
 
 		 287 aa  242  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.18 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.56 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.14 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.44 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.24 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  45.36 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0326  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.14 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.67 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.1 
 
 		 286 aa  235  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.24 
 
 		 286 aa  235  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  44.37 
 
 		 287 aa  235  7e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.87 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.06 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.71 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00792129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  44.1 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0196  Sodium-transporting two-sector ATPase  42.96 
 
 		 291 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.05 
 
 		 291 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.05 
 
 		 291 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.36 
 
 		 286 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3969  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2956  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.01 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0180  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.92 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.64 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1588  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3356  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3014  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.71 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4043  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.01 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.84 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.29 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.1 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4871  ATP synthase F1, gamma subunit  42.81 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.91 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.91 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.01 
 
 		 286 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.01 
 
 		 286 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.64 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.64 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.84 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.69 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.41 
 
 		 287 aa  229  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3895  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.24 
 
 		 294 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.94 
 
 		 286 aa  228  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0419  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.27 
 
 		 290 aa  228  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.01 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2950  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 291 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0738398  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 291 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506697  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0121  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 291 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.01 
 
 		 287 aa  228  8e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.98 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.98 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.98 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.98 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.98 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.94 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.98 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.94 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.98 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.98 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.94 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.98 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.94 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  43.49 
 
 		 288 aa  228  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0096  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 291 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 291 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.94 
 
 		 286 aa  227  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0039  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.24 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0292882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0479  ATP synthase F1, gamma subunit  42.81 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  41.32 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.36 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.06 
 
 		 286 aa  226  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.97 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.6 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.95 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.98 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  41.18 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.94 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>