More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0563 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0563  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
285 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.071167  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  94.74 
 
 
285 aa  555  1e-157  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_502  ATP synthase F1, gamma subunit  96.49 
 
 
285 aa  546  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00717942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.52 
 
 
290 aa  276  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.69 
 
 
290 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  50.73 
 
 
291 aa  275  5e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.17 
 
 
290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.1 
 
 
295 aa  264  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.37 
 
 
281 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.94 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.48 
 
 
288 aa  252  6e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.48 
 
 
288 aa  251  7e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.05 
 
 
291 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.26 
 
 
291 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.26 
 
 
291 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.11 
 
 
288 aa  250  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.42 
 
 
289 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.11 
 
 
288 aa  250  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 
291 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  45.02 
 
 
289 aa  246  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.55 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0371  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.73 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0254  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.08 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85484  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.24 
 
 
289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  44.07 
 
 
291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0307  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 
288 aa  242  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0302  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 
288 aa  242  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73388  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.05 
 
 
286 aa  241  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.6 
 
 
287 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0326  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.05 
 
 
288 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.61 
 
 
283 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.58 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.44 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.55 
 
 
289 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.55 
 
 
289 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.3 
 
 
289 aa  239  5e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  43.06 
 
 
286 aa  238  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0419  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.75 
 
 
290 aa  238  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.6 
 
 
286 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.6 
 
 
286 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.44 
 
 
286 aa  237  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.07 
 
 
293 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 
298 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0196  Sodium-transporting two-sector ATPase  46.44 
 
 
291 aa  236  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.69 
 
 
287 aa  236  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 
286 aa  236  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.95 
 
 
295 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.86 
 
 
283 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.44 
 
 
286 aa  235  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.14 
 
 
286 aa  235  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.44 
 
 
286 aa  234  9e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3895  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.42 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476165  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0039  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.42 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0292882  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.1 
 
 
287 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.15 
 
 
286 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.75 
 
 
291 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.15 
 
 
286 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.1 
 
 
286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.1 
 
 
286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 
286 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  42.47 
 
 
286 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.76 
 
 
287 aa  232  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0011  ATP synthase F1, gamma subunit  44.14 
 
 
287 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.39 
 
 
290 aa  231  7.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.25 
 
 
287 aa  231  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 
289 aa  231  8.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.91 
 
 
287 aa  231  9e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.47 
 
 
293 aa  231  9e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4871  ATP synthase F1, gamma subunit  45.3 
 
 
291 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.75 
 
 
286 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.75 
 
 
286 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
286 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4043  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
291 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.75 
 
 
286 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  44.17 
 
 
287 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.75 
 
 
286 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.98 
 
 
286 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
291 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2950  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
291 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0738398  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0121  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
291 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0096  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
291 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
291 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.15 
 
 
286 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.1 
 
 
286 aa  230  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.75 
 
 
286 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2956  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
291 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3969  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
291 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0180  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
291 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3014  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
291 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3356  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
291 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3527  ATP synthase F1, gamma subunit  43.96 
 
 
293 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0286312 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1588  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 
291 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 
286 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.4 
 
 
286 aa  229  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.73 
 
 
291 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25752  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.66 
 
 
293 aa  228  6e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0479  ATP synthase F1, gamma subunit  43.9 
 
 
291 aa  228  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658838  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.07 
 
 
291 aa  228  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00792129  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.6 
 
 
282 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  42.07 
 
 
288 aa  227  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>