More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0064 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
291 aa  588  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.53 
 
 
290 aa  312  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.16 
 
 
290 aa  304  9.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  50.17 
 
 
285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.19 
 
 
295 aa  281  9e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0563  ATP synthase F1, gamma subunit  50.9 
 
 
285 aa  280  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.071167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.59 
 
 
283 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.86 
 
 
290 aa  276  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_502  ATP synthase F1, gamma subunit  49.46 
 
 
285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00717942  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.28 
 
 
281 aa  268  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.55 
 
 
283 aa  268  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.78 
 
 
298 aa  255  5e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.34 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  43.67 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  46.55 
 
 
287 aa  249  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.05 
 
 
289 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.96 
 
 
286 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 
291 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 
289 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.56 
 
 
289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.56 
 
 
289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 
289 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 
291 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 
291 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 
288 aa  242  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 
288 aa  242  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  44.48 
 
 
287 aa  241  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.33 
 
 
282 aa  241  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0371  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.58 
 
 
288 aa  241  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.58 
 
 
289 aa  241  7.999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.69 
 
 
286 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.69 
 
 
286 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.69 
 
 
286 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.69 
 
 
286 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.69 
 
 
286 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.69 
 
 
286 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.69 
 
 
286 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.69 
 
 
286 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.34 
 
 
286 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.69 
 
 
286 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.98 
 
 
287 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.58 
 
 
287 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0302  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.89 
 
 
288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0307  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.89 
 
 
288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.96 
 
 
288 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.64 
 
 
287 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4871  ATP synthase F1, gamma subunit  41.32 
 
 
291 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0479  ATP synthase F1, gamma subunit  42.01 
 
 
291 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658838  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.8 
 
 
289 aa  236  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0326  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.55 
 
 
288 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  38.84 
 
 
345 aa  236  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  40.48 
 
 
291 aa  236  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.32 
 
 
286 aa  236  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.33 
 
 
293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3527  ATP synthase F1, gamma subunit  40.68 
 
 
293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0286312 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 
290 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  39.86 
 
 
287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.75 
 
 
290 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0254  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.55 
 
 
288 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85484  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.25 
 
 
288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.25 
 
 
288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.66 
 
 
290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 
288 aa  232  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0419  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.61 
 
 
290 aa  232  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.94 
 
 
295 aa  232  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  41.3 
 
 
292 aa  232  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.96 
 
 
287 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.96 
 
 
287 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.27 
 
 
286 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.41 
 
 
287 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  42.61 
 
 
287 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.18 
 
 
288 aa  229  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.3 
 
 
287 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 
287 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 
287 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 
287 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.83 
 
 
287 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 
287 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 
287 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  39.52 
 
 
288 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 
287 aa  229  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.18 
 
 
288 aa  228  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.21 
 
 
286 aa  228  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.82 
 
 
291 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25752  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0196  Sodium-transporting two-sector ATPase  39.59 
 
 
291 aa  227  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 
287 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  40.21 
 
 
287 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 
287 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 
287 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.32 
 
 
293 aa  227  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0180  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.82 
 
 
291 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  40.27 
 
 
289 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.89 
 
 
289 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
293 aa  226  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4043  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.82 
 
 
291 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 
287 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3356  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.82 
 
 
291 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3014  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.82 
 
 
291 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>