More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3151 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
283 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.96 
 
 
283 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.75 
 
 
281 aa  329  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  55.93 
 
 
295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  55.94 
 
 
287 aa  316  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.14 
 
 
298 aa  311  7.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.28 
 
 
282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  50.88 
 
 
287 aa  281  8.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.02 
 
 
290 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.94 
 
 
295 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.83 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.83 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.83 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.83 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.83 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.83 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.83 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.83 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.83 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.83 
 
 
286 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.95 
 
 
290 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.45 
 
 
291 aa  259  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.98 
 
 
289 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.83 
 
 
286 aa  258  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.97 
 
 
290 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.75 
 
 
287 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.4 
 
 
290 aa  256  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.62 
 
 
290 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.1 
 
 
287 aa  254  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.67 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.74 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.79 
 
 
289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  45.07 
 
 
309 aa  253  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  41.96 
 
 
287 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.53 
 
 
288 aa  252  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  48.08 
 
 
287 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  46.18 
 
 
291 aa  249  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  43.99 
 
 
293 aa  249  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.02 
 
 
287 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.01 
 
 
288 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.01 
 
 
288 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.76 
 
 
291 aa  249  4e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.08 
 
 
291 aa  248  7e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.14 
 
 
288 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.14 
 
 
288 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  42.71 
 
 
294 aa  246  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.3 
 
 
291 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  44.74 
 
 
308 aa  245  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.06 
 
 
286 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.58 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.02 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.25 
 
 
287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  42.21 
 
 
289 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.25 
 
 
285 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  45.39 
 
 
294 aa  242  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.83 
 
 
290 aa  242  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.42 
 
 
295 aa  241  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.97 
 
 
288 aa  241  7e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.97 
 
 
288 aa  241  7e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.06 
 
 
288 aa  241  7e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.92 
 
 
291 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.92 
 
 
291 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 
288 aa  240  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  46.15 
 
 
285 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.18 
 
 
290 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 
289 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.56 
 
 
289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.56 
 
 
289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  43.4 
 
 
288 aa  239  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.55 
 
 
291 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.89 
 
 
291 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  43.34 
 
 
295 aa  237  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  43.01 
 
 
286 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.96 
 
 
286 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.96 
 
 
286 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.96 
 
 
286 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.96 
 
 
286 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.96 
 
 
286 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.31 
 
 
286 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.21 
 
 
287 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
293 aa  236  4e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.51 
 
 
287 aa  235  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.16 
 
 
285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.36 
 
 
288 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.26 
 
 
286 aa  235  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.26 
 
 
286 aa  235  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.81 
 
 
299 aa  234  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.76 
 
 
289 aa  234  9e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.41 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  40.41 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  40.87 
 
 
345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.56 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.72 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 
293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.91 
 
 
286 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.94 
 
 
288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.94 
 
 
288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  42.31 
 
 
287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.61 
 
 
286 aa  232  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.07 
 
 
293 aa  232  5e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>