More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1710 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
288 aa  588  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  83.68 
 
 
288 aa  508  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  83.68 
 
 
288 aa  508  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.06 
 
 
286 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.36 
 
 
286 aa  333  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.36 
 
 
286 aa  333  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.36 
 
 
286 aa  333  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.36 
 
 
286 aa  333  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.51 
 
 
285 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.36 
 
 
286 aa  333  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.36 
 
 
286 aa  333  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.36 
 
 
286 aa  333  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.36 
 
 
286 aa  333  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.36 
 
 
286 aa  333  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.86 
 
 
285 aa  332  6e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.02 
 
 
286 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1934  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.04 
 
 
289 aa  293  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0520  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.7 
 
 
292 aa  269  5e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000407991  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0862  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.36 
 
 
293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.337065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  43.21 
 
 
287 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 
283 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 
281 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.62 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.19 
 
 
287 aa  232  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
302 aa  232  7.000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.11 
 
 
291 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.72 
 
 
286 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.72 
 
 
286 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.63 
 
 
287 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.36 
 
 
293 aa  230  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.01 
 
 
293 aa  229  4e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.98 
 
 
314 aa  229  5e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.19 
 
 
287 aa  228  9e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.42 
 
 
282 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  38.89 
 
 
288 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  38.68 
 
 
287 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.06 
 
 
289 aa  226  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.3 
 
 
293 aa  225  6e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.37 
 
 
287 aa  225  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 
291 aa  225  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 
291 aa  225  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.93 
 
 
287 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.37 
 
 
287 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.19 
 
 
286 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.85 
 
 
286 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 
286 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 
288 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.85 
 
 
287 aa  223  4e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.54 
 
 
309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.71 
 
 
291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.15 
 
 
287 aa  221  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 
286 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 
286 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  37.85 
 
 
286 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.19 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.41 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.8 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.85 
 
 
286 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.85 
 
 
286 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.85 
 
 
286 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.85 
 
 
286 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.71 
 
 
291 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.85 
 
 
286 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.81 
 
 
288 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.63 
 
 
287 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.63 
 
 
287 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.81 
 
 
288 aa  218  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.63 
 
 
287 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.63 
 
 
287 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  38.91 
 
 
297 aa  217  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  36.43 
 
 
289 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 
289 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.38 
 
 
288 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.28 
 
 
290 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 
286 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.85 
 
 
288 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.38 
 
 
288 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.67 
 
 
298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  37.99 
 
 
310 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.93 
 
 
287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.93 
 
 
287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.93 
 
 
287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.93 
 
 
287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.28 
 
 
287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.93 
 
 
287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  37.37 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.84 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.37 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.93 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  36.93 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.93 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.93 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  36.93 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.93 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.93 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.63 
 
 
287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.93 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>