More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1870 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
302 aa  617  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0664  F0F1-type ATP synthase, gamma subunit  55.84 
 
 
303 aa  336  1.9999999999999998e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000644453  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.6 
 
 
314 aa  319  3e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1934  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48 
 
 
289 aa  275  7e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0862  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.85 
 
 
293 aa  264  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.337065  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0520  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.2 
 
 
292 aa  256  3e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000407991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.23 
 
 
286 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.23 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.23 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.23 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.23 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.23 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.23 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.23 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.23 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.23 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.9 
 
 
286 aa  252  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.71 
 
 
285 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1239  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.67 
 
 
318 aa  246  4e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.05 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
288 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.07 
 
 
288 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.07 
 
 
288 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  40.4 
 
 
287 aa  222  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.07 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.08 
 
 
283 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.62 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.62 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.09 
 
 
282 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.88 
 
 
293 aa  191  9e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.88 
 
 
288 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.88 
 
 
288 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.21 
 
 
293 aa  189  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  35.43 
 
 
287 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 
286 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.88 
 
 
290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.17 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.97 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.64 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  36.72 
 
 
286 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.11 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  36.18 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.43 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.11 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.11 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 
286 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.86 
 
 
291 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.17 
 
 
286 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 
286 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 
286 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.22 
 
 
291 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00792129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.54 
 
 
286 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.54 
 
 
286 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  34.88 
 
 
287 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2956  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.22 
 
 
291 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0180  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.22 
 
 
291 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3969  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.22 
 
 
291 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3356  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.22 
 
 
291 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3014  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.22 
 
 
291 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.55 
 
 
287 aa  180  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1588  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.22 
 
 
291 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.54 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.55 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0121  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.55 
 
 
291 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2950  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.55 
 
 
291 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0738398  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.55 
 
 
291 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4043  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.89 
 
 
291 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  36.84 
 
 
293 aa  178  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.89 
 
 
291 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25752  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.55 
 
 
286 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.22 
 
 
291 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3967  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.54 
 
 
286 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0127886  normal  0.423609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.55 
 
 
287 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.88 
 
 
290 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.54 
 
 
298 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.55 
 
 
287 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.22 
 
 
291 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.22 
 
 
291 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.54 
 
 
289 aa  176  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.77 
 
 
287 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.87 
 
 
291 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  34.44 
 
 
287 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.56 
 
 
289 aa  175  7e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.77 
 
 
287 aa  175  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.77 
 
 
287 aa  175  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.57 
 
 
287 aa  175  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  36.21 
 
 
286 aa  175  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  35.22 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.89 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.89 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.29 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.55 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0096  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.89 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.77 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  33.65 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.01 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0876  ATP synthase F1, gamma subunit  37.46 
 
 
294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.44 
 
 
287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.44 
 
 
287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>