More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0184 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  100 
 
 
295 aa  596  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  61.09 
 
 
297 aa  360  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  61.36 
 
 
294 aa  359  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  54.39 
 
 
286 aa  316  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.19 
 
 
295 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  54.76 
 
 
293 aa  311  7.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  53.22 
 
 
289 aa  305  4.0000000000000004e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  52.07 
 
 
294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.19 
 
 
290 aa  290  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.49 
 
 
291 aa  289  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.14 
 
 
291 aa  288  8e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  47.7 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  49.32 
 
 
290 aa  281  9e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.44 
 
 
291 aa  278  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.32 
 
 
293 aa  270  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.78 
 
 
292 aa  263  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.05 
 
 
289 aa  257  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.1 
 
 
287 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.1 
 
 
287 aa  255  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.78 
 
 
287 aa  255  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.05 
 
 
288 aa  255  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.44 
 
 
287 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 
288 aa  248  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.78 
 
 
290 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.78 
 
 
290 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.05 
 
 
287 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 
288 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.22 
 
 
290 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.31 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.42 
 
 
289 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.1 
 
 
294 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.34 
 
 
283 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1710  ATP synthase F1, gamma subunit  48.91 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088665  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.71 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.42 
 
 
298 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.66 
 
 
290 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.15 
 
 
292 aa  228  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.1 
 
 
291 aa  228  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  39.71 
 
 
345 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.68 
 
 
299 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.29 
 
 
292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.62 
 
 
291 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.33 
 
 
295 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.15 
 
 
296 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  39.66 
 
 
286 aa  219  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.3 
 
 
283 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.3 
 
 
296 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.72 
 
 
291 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.47 
 
 
298 aa  216  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0558  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.39 
 
 
291 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.91 
 
 
290 aa  216  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0172  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.39 
 
 
291 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.55 
 
 
281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.39 
 
 
293 aa  214  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.74 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.86 
 
 
296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  39.4 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.93 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.28 
 
 
291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.78 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4738  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.29 
 
 
294 aa  212  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  decreased coverage  0.00190337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2830  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.14 
 
 
293 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  41.47 
 
 
294 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0175  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.72 
 
 
292 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.95 
 
 
294 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  40.2 
 
 
299 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.66 
 
 
288 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.66 
 
 
288 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.53 
 
 
295 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.41 
 
 
294 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.1 
 
 
290 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0531  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.39 
 
 
292 aa  208  8e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.74 
 
 
294 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.09 
 
 
291 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 
290 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.87 
 
 
292 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.335228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.56 
 
 
296 aa  205  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  39.66 
 
 
287 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12060  ATP synthase, F1 gamma subunit  38.1 
 
 
308 aa  202  7e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.91 
 
 
286 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.98 
 
 
292 aa  202  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  40.07 
 
 
305 aa  201  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.97 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.57 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.91 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.57 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21410  ATP synthase, F1 gamma subunit  38.49 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.740846  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.91 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.91 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.91 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.91 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.91 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.25 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.91 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.91 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.91 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.23 
 
 
286 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.62 
 
 
315 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  37.71 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>