More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1466 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 		 295 aa  597  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  95.27 
 
 		 296 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  94.59 
 
 		 296 aa  547  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  85.14 
 
 		 296 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  76.27 
 
 		 292 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  75.59 
 
 		 292 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  66.1 
 
 		 291 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.76 
 
 		 293 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  63.73 
 
 		 292 aa  371  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.75 
 
 		 291 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0172  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.54 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  66.22 
 
 		 291 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.42 
 
 		 296 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0558  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.88 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.76 
 
 		 292 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.41 
 
 		 294 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.07 
 
 		 292 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.335228 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.84 
 
 		 290 aa  360  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  63.73 
 
 		 291 aa  360  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.41 
 
 		 294 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1800  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.08 
 
 		 292 aa  359  3e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1733  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.08 
 
 		 292 aa  359  3e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.341678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0175  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.07 
 
 		 292 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0531  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.07 
 
 		 292 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.08 
 
 		 290 aa  357  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  64.07 
 
 		 294 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  63.73 
 
 		 291 aa  356  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2202  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.84 
 
 		 289 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0973  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.16 
 
 		 289 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.82 
 
 		 289 aa  340  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.69 
 
 		 290 aa  333  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4107  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.36 
 
 		 293 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60 
 
 		 294 aa  330  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.86 
 
 		 299 aa  329  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.78 
 
 		 302 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4738  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.63 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  decreased coverage  0.00190337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1314  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.92 
 
 		 293 aa  298  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1680  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.05 
 
 		 296 aa  297  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.97 
 
 		 291 aa  291  6e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  56.27 
 
 		 295 aa  288  6e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.56 
 
 		 290 aa  263  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.84 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.1 
 
 		 288 aa  236  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.61 
 
 		 287 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  42.33 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  43.91 
 
 		 309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  44.59 
 
 		 292 aa  221  9e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.85 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.08 
 
 		 290 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.57 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.03 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.67 
 
 		 287 aa  219  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.59 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.77 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.33 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.37 
 
 		 291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.29 
 
 		 283 aa  215  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  43.14 
 
 		 294 aa  215  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.97 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.54 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.95 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.02 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.89 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.1 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.73 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  40.4 
 
 		 286 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  40.67 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 		 281 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  40.4 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.34 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.05 
 
 		 291 aa  203  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.33 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.89 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  40.34 
 
 		 345 aa  202  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  41.25 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  37.63 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 		 290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  41.69 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2830  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.03 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.52 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.52 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  41.69 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24766  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  38.58 
 
 		 365 aa  193  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.057416  normal  0.404649 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.09 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  40.27 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.47 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  42.02 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1233  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.58 
 
 		 290 aa  188  9e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.72576  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  42.67 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.28 
 
 		 285 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 		 314 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.88 
 
 		 291 aa  185  9e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.56 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  36.58 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  39.93 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  38.33 
 
 		 294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.01 
 
 		 315 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.59 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>