More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1314 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1314  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 		 293 aa  594  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.33 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.92 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.76 
 
 		 292 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.95 
 
 		 290 aa  311  6.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.92 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.72 
 
 		 296 aa  308  9e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.9 
 
 		 291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.7 
 
 		 296 aa  305  6e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.58 
 
 		 291 aa  305  8.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.54 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0172  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.56 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.72 
 
 		 294 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.72 
 
 		 296 aa  300  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.9 
 
 		 291 aa  300  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.88 
 
 		 290 aa  299  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0558  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.88 
 
 		 291 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.38 
 
 		 294 aa  298  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.05 
 
 		 292 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1680  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.76 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.7 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.54 
 
 		 291 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_004310  BR1800  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.9 
 
 		 292 aa  294  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1733  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.9 
 
 		 292 aa  294  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.341678  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.22 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4107  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.58 
 
 		 293 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171115  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0175  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.22 
 
 		 292 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  54.24 
 
 		 294 aa  289  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.27 
 
 		 290 aa  288  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.19 
 
 		 292 aa  288  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.335228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.51 
 
 		 291 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.74 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.18 
 
 		 302 aa  285  5e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0531  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.19 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4738  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.17 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  decreased coverage  0.00190337 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0973  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.88 
 
 		 289 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.54 
 
 		 289 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2202  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.88 
 
 		 289 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  51.84 
 
 		 295 aa  268  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.85 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  46.26 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.44 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.48 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.59 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.86 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.66 
 
 		 287 aa  222  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.66 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.66 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.58 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.86 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.57 
 
 		 290 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.66 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.66 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  42.23 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.55 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  39.59 
 
 		 289 aa  208  8e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  41.23 
 
 		 309 aa  205  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.61 
 
 		 290 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.57 
 
 		 290 aa  205  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  41.53 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.28 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.6 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.74 
 
 		 291 aa  202  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  41.14 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.95 
 
 		 290 aa  202  6e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  39.93 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.73 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  38.59 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.48 
 
 		 283 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.16 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  37.41 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  39.6 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 		 286 aa  192  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.51 
 
 		 286 aa  192  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  40.14 
 
 		 292 aa  192  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  36.78 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  38.72 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.23 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  39.86 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.48 
 
 		 290 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.07 
 
 		 298 aa  189  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.76 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.51 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>