More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2583 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
292 aa  595  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.52 
 
 
290 aa  288  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.52 
 
 
291 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.48 
 
 
290 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.58 
 
 
289 aa  267  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.67 
 
 
298 aa  266  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.36 
 
 
288 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.7 
 
 
287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.26 
 
 
294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.7 
 
 
287 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.36 
 
 
287 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.36 
 
 
287 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2830  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.44 
 
 
293 aa  248  9e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 
290 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.74 
 
 
282 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 
290 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 
290 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.61 
 
 
287 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.3 
 
 
288 aa  239  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.33 
 
 
281 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 
289 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 
288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.96 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.92 
 
 
285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 
283 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.26 
 
 
298 aa  228  9e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.34 
 
 
283 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  40.07 
 
 
309 aa  227  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.78 
 
 
286 aa  226  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 
286 aa  224  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 
286 aa  224  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 
286 aa  224  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 
286 aa  224  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 
286 aa  224  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 
286 aa  224  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 
286 aa  224  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 
286 aa  224  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 
286 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.2 
 
 
290 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 
295 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.41 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 
291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  41.73 
 
 
291 aa  218  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  41.2 
 
 
295 aa  216  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  42.27 
 
 
287 aa  215  7e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  41.4 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  39.12 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  40.61 
 
 
285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.46 
 
 
291 aa  210  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  38.44 
 
 
297 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
290 aa  209  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 
295 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 
290 aa  208  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  41.78 
 
 
287 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
291 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  40.07 
 
 
286 aa  206  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.9 
 
 
287 aa  206  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  35.62 
 
 
291 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  37.93 
 
 
286 aa  202  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.12 
 
 
290 aa  202  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
291 aa  202  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.38 
 
 
290 aa  202  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  39.46 
 
 
294 aa  201  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.97 
 
 
315 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.46 
 
 
292 aa  200  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  37.71 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1737  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.93 
 
 
295 aa  199  6e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.371278  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.52 
 
 
287 aa  198  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.8 
 
 
290 aa  198  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.33 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.33 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.31 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.26 
 
 
292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.26 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0916  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.59 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00701907  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.17 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.17 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.19 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.9 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.05 
 
 
293 aa  196  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.88 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.57 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  39.31 
 
 
287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  37.46 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.57 
 
 
296 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.94 
 
 
291 aa  195  6e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  37.76 
 
 
287 aa  195  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_502  ATP synthase F1, gamma subunit  38.85 
 
 
285 aa  195  9e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00717942  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0563  ATP synthase F1, gamma subunit  38.79 
 
 
285 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.071167  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.35 
 
 
294 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.31 
 
 
315 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  35.67 
 
 
315 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.35 
 
 
294 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0150895  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.44 
 
 
292 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 
299 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.98 
 
 
294 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  35.74 
 
 
294 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 
288 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  35.06 
 
 
345 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>