More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3459 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
292 aa  606  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.17 
 
 
299 aa  279  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.58 
 
 
290 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.29 
 
 
291 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.81 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.77 
 
 
290 aa  262  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.15 
 
 
294 aa  261  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  50.51 
 
 
294 aa  261  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0973  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.86 
 
 
289 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.46 
 
 
291 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.52 
 
 
289 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2202  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.17 
 
 
289 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.12 
 
 
292 aa  255  6e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.94 
 
 
293 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.26 
 
 
291 aa  252  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.12 
 
 
287 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.32 
 
 
290 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1680  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.67 
 
 
296 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.12 
 
 
287 aa  250  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.29 
 
 
291 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.95 
 
 
288 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.76 
 
 
292 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.42 
 
 
287 aa  248  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0172  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.63 
 
 
291 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0175  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.12 
 
 
292 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0558  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.95 
 
 
291 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.1 
 
 
287 aa  248  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.76 
 
 
292 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.96 
 
 
291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0531  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.78 
 
 
292 aa  241  7e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.64 
 
 
294 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1733  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.96 
 
 
292 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.341678  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1800  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.96 
 
 
292 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907814  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.3 
 
 
294 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.12 
 
 
296 aa  239  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4738  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.26 
 
 
294 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  decreased coverage  0.00190337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.59 
 
 
295 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.75 
 
 
287 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4107  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.12 
 
 
293 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.2 
 
 
288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.45 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.44 
 
 
296 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.39 
 
 
292 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.335228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.12 
 
 
296 aa  232  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1314  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.26 
 
 
293 aa  231  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.92 
 
 
292 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.26 
 
 
302 aa  228  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.24 
 
 
288 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  41.81 
 
 
294 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.26 
 
 
291 aa  223  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213985  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  46.62 
 
 
295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.54 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.54 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.18 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  40 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  40.2 
 
 
286 aa  212  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  40.27 
 
 
293 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.27 
 
 
289 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.82 
 
 
290 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.82 
 
 
290 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  40.58 
 
 
305 aa  205  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.75 
 
 
282 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.78 
 
 
291 aa  204  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.72 
 
 
291 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37 
 
 
298 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.44 
 
 
291 aa  202  7e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.46 
 
 
295 aa  202  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  38.38 
 
 
295 aa  201  8e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  37.92 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.55 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 
298 aa  199  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.85 
 
 
290 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.98 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.7 
 
 
283 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.7 
 
 
283 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.51 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.98 
 
 
290 aa  194  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  39.39 
 
 
292 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.31 
 
 
290 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.33 
 
 
294 aa  192  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.93 
 
 
292 aa  191  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  38.19 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.14 
 
 
285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  36.39 
 
 
294 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 
286 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 
286 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 
286 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 
286 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 
286 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.11 
 
 
285 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 
286 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 
286 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 
286 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.28 
 
 
291 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 
286 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 
286 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.28 
 
 
291 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.36 
 
 
286 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.74 
 
 
291 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.38 
 
 
315 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>