More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2331 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
291 aa  593  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  84.83 
 
 
291 aa  508  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  80.41 
 
 
291 aa  489  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  79.73 
 
 
290 aa  471  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  80 
 
 
292 aa  461  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  79.04 
 
 
293 aa  454  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  74.4 
 
 
295 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  47.7 
 
 
309 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  48.14 
 
 
295 aa  288  8e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  50 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  47.75 
 
 
294 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  48.65 
 
 
297 aa  278  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  47.44 
 
 
293 aa  276  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.92 
 
 
287 aa  265  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.55 
 
 
282 aa  263  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.74 
 
 
287 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.02 
 
 
287 aa  257  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.39 
 
 
287 aa  255  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 
288 aa  255  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.05 
 
 
287 aa  254  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.92 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.92 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.32 
 
 
289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.26 
 
 
290 aa  252  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 
289 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.76 
 
 
283 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 
288 aa  242  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.14 
 
 
281 aa  242  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.15 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.57 
 
 
291 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  39.93 
 
 
290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  43.2 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.77 
 
 
298 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  42.76 
 
 
286 aa  228  8e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  38.75 
 
 
345 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.96 
 
 
283 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.07 
 
 
294 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
290 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2830  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.22 
 
 
293 aa  221  8e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  41.55 
 
 
287 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  40.92 
 
 
295 aa  217  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.24 
 
 
299 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.67 
 
 
298 aa  215  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.86 
 
 
292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.91 
 
 
288 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.91 
 
 
288 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  39.46 
 
 
292 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12060  ATP synthase, F1 gamma subunit  36.86 
 
 
308 aa  208  7e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  37.37 
 
 
286 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.26 
 
 
296 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 
285 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.58 
 
 
292 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21410  ATP synthase, F1 gamma subunit  37.38 
 
 
303 aa  207  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.740846  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  39.09 
 
 
305 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.73 
 
 
295 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.28 
 
 
285 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.43 
 
 
291 aa  204  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.8 
 
 
290 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.14 
 
 
292 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1800  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.47 
 
 
292 aa  203  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.38 
 
 
315 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
291 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1733  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.47 
 
 
292 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.341678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  40.07 
 
 
287 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 
293 aa  202  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.94 
 
 
292 aa  202  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.39 
 
 
315 aa  201  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  38.57 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.69 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1557  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.13 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.02 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  38.1 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.5 
 
 
291 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.2 
 
 
296 aa  199  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.95 
 
 
296 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.26 
 
 
296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.43 
 
 
290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.85 
 
 
289 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1044  ATP synthase F1, gamma subunit  39.02 
 
 
302 aa  199  6e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.129689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.94 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  37.8 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.72 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.2 
 
 
286 aa  196  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.94 
 
 
294 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  37.62 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.8 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.19 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.43 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.46 
 
 
295 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1710  ATP synthase F1, gamma subunit  41.67 
 
 
270 aa  196  5.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
286 aa  195  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.54 
 
 
286 aa  195  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.8 
 
 
289 aa  195  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
286 aa  195  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
286 aa  195  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.26 
 
 
288 aa  195  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
286 aa  195  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1737  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.23 
 
 
295 aa  195  6e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.371278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
286 aa  195  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>