More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2194 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
291 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2830  F0F1 ATP synthase subunit gamma  86.01 
 
 
293 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  78.01 
 
 
290 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.72 
 
 
289 aa  425  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.07 
 
 
290 aa  408  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.31 
 
 
294 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.82 
 
 
298 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  50.52 
 
 
292 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.14 
 
 
291 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43 
 
 
290 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.02 
 
 
288 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 
282 aa  238  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.57 
 
 
291 aa  238  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 
295 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  42.37 
 
 
294 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.86 
 
 
287 aa  235  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.72 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  42.71 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.21 
 
 
287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  42.18 
 
 
297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.67 
 
 
299 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  39.41 
 
 
309 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
291 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43 
 
 
283 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.84 
 
 
290 aa  228  6e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43 
 
 
291 aa  228  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 
293 aa  228  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.22 
 
 
290 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.88 
 
 
290 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.61 
 
 
287 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.71 
 
 
291 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.28 
 
 
287 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  39.46 
 
 
293 aa  222  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43 
 
 
292 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  40.33 
 
 
295 aa  219  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.62 
 
 
292 aa  219  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.67 
 
 
292 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.54 
 
 
294 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.03 
 
 
281 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.24 
 
 
296 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.71 
 
 
298 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.37 
 
 
295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.91 
 
 
296 aa  215  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.42 
 
 
292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.24 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.98 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.26 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  40.14 
 
 
287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1800  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.5 
 
 
292 aa  212  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1733  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.5 
 
 
292 aa  212  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.341678  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.05 
 
 
293 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  38.54 
 
 
287 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.22 
 
 
296 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  39.73 
 
 
291 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.5 
 
 
292 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.2 
 
 
288 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.2 
 
 
288 aa  208  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.82 
 
 
288 aa  208  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2202  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.64 
 
 
289 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.22 
 
 
296 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.7 
 
 
291 aa  206  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.33 
 
 
294 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.91 
 
 
294 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
290 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.88 
 
 
290 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0175  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.94 
 
 
292 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0558  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.6 
 
 
291 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
290 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.96 
 
 
289 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0973  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.96 
 
 
289 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1026  ATP synthase F1, gamma subunit  36.64 
 
 
295 aa  202  4e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.28 
 
 
288 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.28 
 
 
288 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4107  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41 
 
 
293 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171115  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.96 
 
 
290 aa  201  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0172  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.13 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.93 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1557  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.84 
 
 
292 aa  199  3e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.07 
 
 
291 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  36.49 
 
 
345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1680  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.23 
 
 
296 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 
295 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.7 
 
 
287 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.32 
 
 
290 aa  198  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.18 
 
 
293 aa  198  7.999999999999999e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  37.46 
 
 
286 aa  198  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.88 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  36.3 
 
 
286 aa  196  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 
286 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  40.41 
 
 
287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.83 
 
 
286 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.83 
 
 
286 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.83 
 
 
286 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.83 
 
 
286 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.11 
 
 
286 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.69 
 
 
302 aa  195  8.000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.2 
 
 
286 aa  195  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>