More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6063 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
305 aa  616  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.49 
 
 
290 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.51 
 
 
290 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.51 
 
 
290 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.02 
 
 
289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.26 
 
 
287 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.83 
 
 
288 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.83 
 
 
288 aa  254  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.02 
 
 
287 aa  254  9e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.41 
 
 
287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.66 
 
 
288 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.98 
 
 
287 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  45.63 
 
 
309 aa  244  9e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.8 
 
 
287 aa  242  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.05 
 
 
282 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.95 
 
 
288 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.95 
 
 
288 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  38.75 
 
 
345 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.56 
 
 
291 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.13 
 
 
283 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.62 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  42.95 
 
 
287 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.48 
 
 
299 aa  218  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.23 
 
 
295 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.46 
 
 
283 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.04 
 
 
290 aa  217  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  38.31 
 
 
293 aa  216  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.82 
 
 
289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  39.74 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  39.41 
 
 
297 aa  211  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.74 
 
 
291 aa  211  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 
291 aa  210  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.23 
 
 
292 aa  208  7e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.91 
 
 
293 aa  207  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  41.51 
 
 
315 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 
294 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  37.79 
 
 
289 aa  206  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.45 
 
 
298 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 
291 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.62 
 
 
316 aa  206  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.88 
 
 
315 aa  205  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.83 
 
 
287 aa  205  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.36 
 
 
293 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  39.41 
 
 
295 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.39 
 
 
285 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 
294 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.03 
 
 
298 aa  202  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  37.7 
 
 
286 aa  202  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.31 
 
 
287 aa  202  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.13 
 
 
296 aa  202  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  42.86 
 
 
294 aa  202  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  41.88 
 
 
299 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.91 
 
 
291 aa  201  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_004310  BR1800  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.04 
 
 
292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.97 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.74 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.23 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1733  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.04 
 
 
292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.341678  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1680  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.45 
 
 
296 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  40.89 
 
 
292 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.13 
 
 
315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.89 
 
 
291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.42 
 
 
292 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.09 
 
 
290 aa  199  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  38.89 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  39.74 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.54 
 
 
290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.49 
 
 
314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.97 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.89 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.23 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4107  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.3 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.72 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.89 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
293 aa  197  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.42 
 
 
293 aa  196  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.69 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.16 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.58 
 
 
293 aa  196  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  35.87 
 
 
290 aa  196  6e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  36.96 
 
 
289 aa  195  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.02 
 
 
295 aa  195  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.03 
 
 
292 aa  195  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0514  ATP synthase F1, gamma subunit  38.31 
 
 
294 aa  194  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.65 
 
 
292 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.53 
 
 
290 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.06 
 
 
290 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.18 
 
 
287 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.25 
 
 
285 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.45 
 
 
292 aa  193  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.35 
 
 
290 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.97 
 
 
288 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.18 
 
 
287 aa  192  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.97 
 
 
288 aa  192  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.63 
 
 
293 aa  192  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0326  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.3 
 
 
288 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 
287 aa  192  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1404  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.6 
 
 
295 aa  192  9e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207703  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0172  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.87 
 
 
291 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.72 
 
 
290 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>